基于全基因组系统发生的草菇基因家族显著扩增

文献类型： 中文期刊

第一作者： 龚明

作者： 龚明;谭琦;陈明杰;鲍大鹏;汪虹

作者机构：

关键词： 草菇;自溶;基因扩增;全基因组;异常代谢

期刊名称： 微生物学报

ISSN： 0001-6209

年卷期： 2014 年 54 卷 09 期

页码： 992-997

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】从基因组层次研究草菇低温自溶异常代谢的分子特征。【方法】对21个真菌物种进行全基因组系统发生分析,进而选取其中具有代表性的物种进行比较基因组学分析,系统研究草菇异常代谢分子特征。【结果】全基因组系统发生分析结果显示草菇位于草腐菌所形成簇的底端。基于全基因组系统发生树,由于担子菌和子囊菌属于完全不同的演化路径,所以选取担子菌中具有代表性的9个物种进行比较基因组学分析,结果显示相比于其它草腐菌,草菇基因家族具有一定的收缩趋势。进一步对不同范畴的基因家族数目进行比较,结果显示3个大于200的草菇基因家族(fam1、fam4和fam6)分别发生了显著扩增,且在总数上也显著高于其它物种,表明草菇的这一分子特征与其异常代谢相关。【结论】3个草菇基因家族(>200)显著扩增提示其特定基因家族功能加强,很可能与草菇低温自溶密切相关。

分类号： S646.13

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