基于SSR标记的文冠果遗传多样性分析及指纹图谱构建

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李思琪

作者： 李思琪;张文臣;杨柳;付庆新;洪新;张海旺

作者机构：

关键词： 文冠果;品种(系);SSR荧光标记;遗传多样性;指纹图谱;分子身份证;聚类分析

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2024 年 005 期

页码： 74-83

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】为快速鉴定和利用文冠果种质资源，探明文冠果种质亲缘关系。【方法】从20对SSR引物筛选得到11对条带清晰、多态性好的引物，对29个文冠果品种（系）进行分析，采用荧光毛细管电泳技术进行多态检测，通过邻接法进行聚类分析，利用数字和字母赋值编码构建分子身份证。【结果】共检测到66个等位基因（Na），每对引物检测到3-10个Na。Shannon信息指数（I）变化范围介于0.349-1.723之间，平均值为1.16。不同引物揭示的多态信息含量（PIC）变幅介于0.276-0.841，平均为0.66。观测杂合度（Ho）变幅为0.137-0.958，平均值为0.739；期望杂合度（He）变幅为0.187-0.79，平均值为0.648；在11个位点中，有7个位点的平均观测杂合度大于平均期望杂合度。遗传相似系数变化范围为0-1，平均为0.31，遗传相似系数在0.6以上的有15个，仅占全部数据的5.17%。邻接法聚类分析结果显示，在遗传距离为0.42时，可将29份文冠果种质分为三大类群。构建了0/1形式的指纹数据库和分子身份证，除个别品种外均具有唯一性，可用于品种鉴定。【结论】29份文冠果种质资源的遗传多样性相对较高，但也存在一定的近交现象。利用SSR标记构建文冠果分子身份证操作简便可行，可为文冠果品种真伪鉴定、权益保护、身份识别、溯源管理及新品种选育提供技术支撑和科学依据。

分类号： Q943.2%S794.9

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