植物复杂基因组与泛基因组研究现状与展望
文献类型: 中文期刊
第一作者: 王英豪
作者: 王英豪;余嘉鑫;唐海宝;张兴坦
作者机构:
关键词: 植物基因组学;测序技术;组装算法;植物复杂基因组;植物泛基因组
期刊名称: 中国科学(生命科学)
ISSN: 1674-7232
年卷期: 2024 年 002 期
页码: 233-246
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 基因组是指一个生物体内遗传物质的总和,是生物学研究的关键之一.自2000年拟南芥基因组被测序发表以来,已有超过800个植物基因组相继被破解,极大促进了植物分子生物学、遗传学等领域的发展.即便如此,植物基因组学研究仍然面临一系列挑战,包括高杂合、高重复度、高倍性等复杂基因组的组装和泛基因组的构建等.本文从植物基因组学的发展概况、基因组测序技术、组装算法等三个方面,全面展示了植物基因组的快速发展.其中,介绍了简单基因组装和复杂基因组装的相关策略,总结了“端粒到端粒”(telomere-to-telomere或称T2T)的组装和泛基因组构建方法以及其重要性.最后,对未来植物基因组的发展进行了展望,认为随着技术的不断进步,基因组解析技术和方法将会更加完善,为植物基因组的深入研究提供更多支持.本文为植物T2T、复杂基因组组装和泛基因组的构建方法研究提供了参考依据.
分类号: Q943.2
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