植物复杂基因组与泛基因组研究现状与展望

文献类型: 中文期刊

第一作者: 王英豪

作者: 王英豪;余嘉鑫;唐海宝;张兴坦

作者机构:

关键词: 植物基因组学;测序技术;组装算法;植物复杂基因组;植物泛基因组

期刊名称: 中国科学(生命科学)

ISSN: 1674-7232

年卷期: 2024 年 002 期

页码: 233-246

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 基因组是指一个生物体内遗传物质的总和,是生物学研究的关键之一.自2000年拟南芥基因组被测序发表以来,已有超过800个植物基因组相继被破解,极大促进了植物分子生物学、遗传学等领域的发展.即便如此,植物基因组学研究仍然面临一系列挑战,包括高杂合、高重复度、高倍性等复杂基因组的组装和泛基因组的构建等.本文从植物基因组学的发展概况、基因组测序技术、组装算法等三个方面,全面展示了植物基因组的快速发展.其中,介绍了简单基因组装和复杂基因组装的相关策略,总结了“端粒到端粒”(telomere-to-telomere或称T2T)的组装和泛基因组构建方法以及其重要性.最后,对未来植物基因组的发展进行了展望,认为随着技术的不断进步,基因组解析技术和方法将会更加完善,为植物基因组的深入研究提供更多支持.本文为植物T2T、复杂基因组组装和泛基因组的构建方法研究提供了参考依据.

分类号: Q943.2

  • 相关文献

[1]深度学习在植物基因组学与作物育种中的应用现状与展望. 侯祥英,崔运鹏,刘娟. 2022

[2]动物胃肠道菌群检测技术的研究进展. 罗旭,姜宁,张爱忠,刘国君,张颖. 2017

[3]正常发育与发育阻遏雌虫差异表达miRNA分析. 韩愉,乔洪宾,冯金涛,刘金明,李浩,陆珂,金亚美. 2015

[4]SmallRNA-植物与病原互作的新媒介. 彭德良. 2015

[5]烟草基因组学研究方法篇:6。生物信息学在烟草基因组研究中的应用. 龚达平. 2011

[6]农业昆虫气味受体功能研究进展. 游银伟,张龙. 2021

[7]绵羊皮肤转录组denove组装及其特征. 岳耀敬,冯瑞林,王天翔,郭婷婷,李桂英,孙晓萍,刘建斌,李文辉,牛春娥,郭健,李范文,杨博辉. 2015

[8]核酸技术在食源性致病菌检测中的研究进展. 高雯暄,甘芝霖,陈爱亮,徐贞贞,孙爱东,李会. 2020

[9]高通量筛选差异表达基因技术简介. 狄冉,储明星. 2010

[10]基于高通量测序的氮高效相关基因的鉴定. 郝青南,王程,陈水莲,沙爱华,单志慧,陈海峰,周蓉,周新安. 2012

[11]基于免扩增高通量测序的转基因定量检测方法研究. 李凯,付军,陈锐,陈笑芸,李亮. 2024

[12]小麦条锈病抗性基因定位及分子标记技术研究进展. 杨芳萍,曹世勤,郭莹,杜久元,鲁清林,吕迎春,白斌,周刚,张文涛,马瑞,何瑞. 2024

[13]番茄基因组研究进展. 唐亚萍,李宁,王娟,王柏柯,杨生保,郭斌,杨涛,郭春苗,马凯,刘君,王欢,余庆辉. 2019

[14]转录组学技术及其在水貂上的研究进展. 刘乃榕,王全凯,邢秀梅,荣敏. 2019

[15]禾谷孢囊线虫(Heteroderaavenae)不同龄期转录组比较分析. 王高峰,彭焕,黄文坤,孔令安,彭德良. 2014

作者其他论文 更多>>