茶树GRF转录因子的比较基因组学和杂种优势

文献类型： 中文期刊

第一作者： 侯炳豪

作者： 侯炳豪;王鹏杰;郭永春;王丽;谷梦雅;张兴坦;叶乃兴

作者机构：

关键词： 茶树;铁观音;黄棪;GRF转录因子;比较基因组;杂种优势

期刊名称： 应用与环境生物学报

ISSN： 1006-687X

年卷期： 2022 年 28 卷 006 期

页码： 1477-1484

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 生长调控因子(growth-regulation factor,GRF)是植物在调控生长发育中起重要作用的一类转录因子.利用生物信息学的方法,在铁观音、黄棪和舒茶早3个茶树基因组进行GRF基因家族的比较基因组分析,分别鉴定获得15、16和14个CsGRF基因家族成员,均具有完整的QLQ和WRC特征结构域.基于系统进化关系可将CsGRF分为6组,同一分组的基因结构与蛋白保守基序相似.CsGRF启动子上存在大量与光响应、激素响应与胁迫响应相关的顺式作用元件.不同组织转录组数据分析表明,CsGRF在茶树的幼嫩芽叶中表达量高,成熟叶和根中表达量低甚至不表达.荧光定量结果发现,铁观音CsGRF表达量明显低于黄棪的表达量;人工杂交F1代品种间CsGRF表达量存在差异,金观音CsGRF的表达量整体上稍高于母本铁观音,但不显著;黄观音CsGRF3、CsGRF7、CsGRF10、CsGRF12的表达量显著高于母本铁观音,CsGRF2、CsGRF5、CsGRF6、CsGRF14呈现超高亲表达,且CsGRF2达到显著水平;金牡丹CsGRF3和CsGRF5的表达量显著高于母本;紫玫瑰CsGRF的表达量除CsGRF6外均高于铁观音,CsGRF1、CsGRF2、CsGRF4、CsGRF5、CsGRF9和CsGRF14呈现超高亲表达,且除了CsGRF9外均达到显著水平.本研究推测部分CsGRF在杂交子代中的优势表达可能与茶树生长势杂种优势的形成有关.

分类号： S571.1

  • 相关文献

[1]不同种植年限铁观音茶树根系分泌物的GC-MS分析. 李艳春,叶菁,王义祥. 2021

[2]铁观音茶树不同叶位和氮肥用量对叶片叶绿素含量的影响. 戴春山,孔庆波,张青,章明清,李娟. 2014

[3]铁观音低产茶园综合改造成效分析. 杨如兴,王文建,张磊,黄东方,吴民亿,钟臻安,陈芝芝. 2010

[4]基于高光谱参量茶叶叶绿素含量估算模型研究. 孔庆波,张青,章明清,李娟. 2014

[5]藜麦GRF转录因子家族的鉴定及表达分析. 时丕彪,何冰,费月跃,王军,王伟义,魏福友,吕远大,顾闽峰. 2019

[6]蓖麻GRF转录因子家族生物信息学鉴定及表达分析. 代梦媛,高梅,李文昌. 2021

[7]我所茶树杂种优势利用研究进展与展望. 雷雨,段继华,张曙光,贺利雄,董丽娟. 2014

[8]茶树杂交F_1主要品质成分杂种优势与混合遗传分析. 雷雨,段继华,黄飞毅,康彦凯,罗意,陈莹玉,丁玎,李赛君. 2023

[9]分子标记技术在茶树杂种优势预测中的应用展望. 刘本英,成浩. 2007

[10]做青对黄棪乌龙茶香气与醇系香气前体分布的影响. 苗爱清,江和源,李家贤,胡海涛,何玉媚,庞式. 2008

[11]‘佛手’等3个品种茶园施肥限量标准研究. 李娟,章明清,尤志明,章赞德,姚建族,苏火贵. 2018

[12]黄棪原料香气与糖苷类香气前体的分布研究. 苗爱清,江和源,李家贤,胡海涛,何玉媚,韩宝瑜. 2003

[13]牧草分子遗传连锁图谱及其应用. 谢文刚,刘文献,张建全,王彦荣. 2014

[14]苏云金芽胞杆菌G03菌株的比较基因组分析. 姚萌,王奎,束长龙,杜立新,李海涛,丁明月,刘荣梅. 2018

[15]马基因组研究进展. 杨虹,马月辉,李蓓,芒来. 2010

[16]甘蔗遗传多样性的分子检测. 陈辉,范源洪. 2003

[17]牛带绦虫和亚洲带绦虫全基因组测序、比较基因组及胰岛素信号通路研究. 王帅,才学鹏. 2015

[18]生防菌Bacillus subtilis DNKAS全基因组测序及生物膜形成相关基因分析. 王骞,包慧芳,丁荣荣,史应武,杨红梅,楚敏,王宁. 2022

[19]比较基因组揭示广西酸菜乳杆菌碳水化合物活性酶谱. 彭明芳,李培骏,单杨,陈玉秋,杨岱峻,雷丽嫦,黄芝辉,余孔新. 2021

[20]鳞翅目昆虫比较线粒体基因组学研究进展. 王维,孟智启,石放雄,李风波. 2013

作者其他论文 更多>>

微信小程序