芝麻MATE基因家族的全基因组鉴定与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 梁俊超

作者： 梁俊超;孙建;颜廷献;乐美旺;饶月亮;颜小文;周红英

作者机构：

关键词： 芝麻;MATE基因家族;系统进化分析;保守基序

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN：

年卷期： 2021 年 002 期

页码： 735-746

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 植物为了维持其生命系统的正常运转,需要对各种代谢产物和毒素进行转运和排出。多药与毒性化合物排出转运蛋白（multidrug and toxic compound extrusion, MATE）在多种底物和毒素的运输中起到重要作用。本研究利用生物信息学手段对芝麻MATE基因家族进行了全基因组分析,鉴定得到67个MATE基因,分布于全部13条染色体上,亚细胞定位预测表明这些基因主要位于质膜上。串联复制和全基因组复制是芝麻MATE基因家族扩增的主要动力。比较基因组学分析发现在芝麻和拟南芥中具有许多共线性的MATE基因,且大部分串联复制SiMATE基因产生于芝麻和拟南芥分化之后。系统进化分析可将芝麻MATE成员分为4个亚家族,大部分相似功能的已知植物MATE成员被聚在同一分枝中,进化树中关系较近的芝麻MATE成员往往具有相似的基因结构和保守基序。基因表达分析表明一半以上的SiMATE基因具有组织表达特异性。这些结果为芝麻MATE基因功能的研究提供了重要参考。

分类号： S565.3

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