猪流行性腹泻病毒ORF3和M基因的克隆与序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王隆柏

作者： 王隆柏;吴学敏;车勇良;陈如敬;魏宏;刘玉涛;庄向生;周伦江

作者机构：

关键词： 猪流行性腹泻病毒;ORF3基因;M基因;序列分析

期刊名称： 中国动物传染病学报

ISSN： 1674-6422

年卷期： 2012 年 20 卷 03 期

页码： 67-72

摘要： 为了解福建省猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)毒株ORF3和M基因变异情况,本研究从4个不同规模猪场发生仔猪"顽固性腹泻"疾病的病料中扩增到4株PEDV的ORF3和M基因,并进行了序列分析。结果表明:4株PEDV ORF3基因均含有675个碱基,编码224个氨基酸,与GenBank中登录的代表性PEDV核苷酸的同源性为89.7%～100.0%,氨基酸的同源性为94.7%～99.6%,其中FJPT毒株核苷酸的同源性与CV777 truncated毒株最低,仅为89.7%,FJNP毒株核苷酸的同源性与中国北方流行的CH ZKFG 11毒株最高,达100.0%。M基因含有681个碱基,编码226个氨基酸,与GenBank中登录的代表性PEDV核苷酸的同源性为94.8%～100.0%,氨基酸的同源性为94.8%～99.6%,其中FJPT毒株核苷酸的同源性与日本D89752毒株最低,仅为94.8%,FJNP毒株核苷酸的同源性与韩国CPF193、泰国毒株最高,达100.0%。4株PEDV毒株均与国内外流行强毒株的亲缘关系较近,与attenuate DR13弱毒株的亲缘关系较远。

分类号： S852.659.6

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