采用GBS-seq技术构建甜瓜高密度遗传图谱

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张学军

作者： 张学军;杨文莉;张永兵;张健;郭丽霞;杨永;李寐华;伊鸿平

作者机构：

关键词： 甜瓜;GBS;遗传图谱;霜霉病;QTL

期刊名称： 新疆农业科学

ISSN： 1001-4330

年卷期： 2019 年 56 卷 10 期

页码： 1828-1838

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】构建甜瓜高密度遗传图谱,为研究甜瓜重要性状基因定位及功能分析奠定基础。【方法】以甜瓜材料K7-4(高抗霜霉病)和K7-2(高感霜霉病)为亲本,杂交再自交得到F_2分离群体。构建GBS文库并进行双末端测序,使用滑动窗口的方法进行基因型分型,SAM TOOLS软件检测SNP位点,采用Joinmap 4.0软件进行排图,用perl SVG模块绘制连锁图,用win QTL cart 2.5进行QTL检验,根据复合区间作图法,使用R/qtl软件包进行QTL定位。【结果】构建了总长为4 823.55 cM的遗传图谱,标记间平均遗传距离为1.43 cM。在苗期、生长中期和生长后期共检测到26个与甜瓜霜霉病性状相关的QTL。【结论】基于GBS-seq技术获得了甜瓜高密度遗传图谱,最终将抗霜霉病基因关联到CM3.5.1_scaffold00005上的6,831,227～7,830,935 bp,约1Mb的区间范围内。

分类号： S652

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