绵羊BTG1基因的半定量RT-PCR及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 张菊

作者: 张菊;杜立新;李宏滨;魏彩虹

作者机构:

关键词: B细胞易位基因1(BTG1基因);cDNA克隆;半定量RT-PCR;生物信息学预测

期刊名称: 中国生物化学与分子生物学报

ISSN: 1007-7626

年卷期: 2009 年 25 卷 10 期

页码: 911-917

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: B细胞易位基因1(BTG1基因)是BTG/TOB基因家族的成员之一,在动物细胞的增殖和分化中起重要的作用.利用牛BTG1基因的mRNA序列与绵羊的EST数据库进行Blast检索,并通过序列拼接和逆转录RT-PCR方法首次获得绵羊BTG1基因的部分cDNA序列(GenBank登录号FJ444829),其片段长度为1 358 bp,包括完整的开放阅读框516 bp,编码171个氨基酸.半定量PCR研究结果表明:BTG1基因在小尾寒羊和陶赛特羊的10种组织中均表达,并具有一致的表达趋势.同源分析结果表明,绵羊BTG1蛋白的氨基酸序列中存在BTG/TOB的保守结构域,并且该蛋白在不同物种间具有很高的保守性.通过生物信息学预测BTG1蛋白功能,发现绵羊BTG1蛋白存在1个跨膜结构域、8个磷酸化位点和1个特异性蛋白激酶磷酸化位点.蛋白质结构同源建模分析表明,绵羊BTG1蛋白具有BTG/TOB蛋白家族的典型空间结构.

分类号: Q78

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