内江猪的遗传结构分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 杨雪梅

作者: 杨雪梅;陶璇;顾以韧;梁艳;雷云峰;杨跃奎;曾凯;王言;陈晓晖;龚建军;吕学斌

作者机构:

关键词: 内江猪;SNP芯片;遗传结构

期刊名称: 畜牧与兽医

ISSN: 0529-5130

年卷期: 2024 年 56 卷 009 期

页码: 23-27

收录情况: 北大核心

摘要: 旨在研究内江猪群体的亲缘关系和遗传结构。采用“中芯一号”芯片检测30头内江猪的单核苷酸多态性(SNP);采用GCTA软件构建G矩阵,PLINK软件构建状态同源(IBS)距离矩阵,分析内江猪群体的亲缘关系;采用Mega X软件构建群体进化树,分析内江猪群体的遗传结构。结果:共检测到57 466个SNP位点,29 468个SNP位点通过质量控制;内江猪试验群体具有中等程度的亲缘关系;群体进化树将内江猪公猪被分为6个血缘,血缘数量与传统系谱记录的基本相同;基于连续性纯合片段(ROH)的平均近交系数为0.243。综上,内江猪血缘较少,有一定程度的近交,可引入新血缘,提高群体遗传多样性和种群质量。

分类号: S828

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