基于转录组测序的枇杷腋芽成花相关基因的筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 章加应

作者： 章加应;肖海涛;张学英;安海山;徐芳杰;周博强

作者机构：

关键词： 枇杷;腋芽成花;转录组分析

期刊名称： 上海农业学报

ISSN： 1000-3924

年卷期： 2022 年 38 卷 006 期

页码： 47-57

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以枇杷品系春花(具有腋芽成花特性)和品种'火炬'(不具有腋芽成花特性)为试验材料,利用RNA-seq技术对枇杷腋芽进行转录组测序,以期筛选出调控枇杷腋芽成花的关键基因.结果表明:共鉴定到66 197条差异表达基因,其中上调表达基因主要集中在2月27日-4月8日;维恩图分析显示,不同取样点共同上调表达的基因有160个,共同下调表达的基因有198个.差异表达基因GO功能注释到3个大类(生物过程、细胞组分和分子功能)的48个功能组,KEGG通路显著性富集分析表明,差异基因主要被注释到20个途径上,富集于植物激素信号传导、淀粉和糖代谢、苯基丙烷代谢、植物-病原体互作反应和谷胱甘肽代谢等途径.经功能注释后,最终从腋芽转录组筛选到32个成花基因、1个ABA受体基因PYLA、1个ABA脱氢酶基因ABH4和大量功能未知的新基因,这些基因可能在枇杷腋芽成花途径中起重要作用.本研究有助于更好地了解枇杷腋芽成花过程中的基因转录水平,也可为进一步解析枇杷腋芽成花的分子遗传机制奠定基础.

分类号： S667.3

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