小麦反转录转座子家族鉴定及其转录活性分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 唐益苗

作者: 唐益苗;马有志;李连城;辛志勇

作者机构:

关键词: 小麦;反转录转座子;反转录酶片段;进化

期刊名称: 科学通报

ISSN: 0023-074X

年卷期: 2005 年 50 卷 06 期

页码: 44-49

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 根据反转录转座子的反转录酶(reversetranscriptase,RT)区域序列特征,研究了小麦基因组中反转录转座子家族构成及其进化关系.根据反转录转座子RT保守序列设计引物,通过RTPCR从接种白粉病菌的小麦品系Pm97034的cDNA中扩增了一批RT片段.对51个随机克隆(RT1~51)的测序结果表明:它们之间具有高度异质性,核苷酸的同源性在75.4%~97.9%.结合已报道的7个小麦反转录转座子家族(family1~7)的代表序列,构建了系统发育树,发现3个新的家族,分别命名为family8,family9和family10.其中,family8是发生Pooideae亚族分化之前,是一类古老的反转录转座子家族.另外,family4和family7这2个家族中某些成员具有转录活性,并以高拷贝的形式存在于小麦及其近缘属的基因组中.

分类号: S512.1

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