小麦PHO基因家族全基因组鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郝小聪

作者： 郝小聪;王伟伟;汪德州;房兆峰;柳珊;朱文根;逄子剑;张胜全;赵昌平;张风廷;唐益苗

作者机构：

关键词： 小麦;PHO基因家族;进化系统分析;表达分析;磷转运蛋白

期刊名称： 麦类作物学报

ISSN： 1009-1041

年卷期： 2023 年 43 卷 001 期

页码： 26-35

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： PHO基因家族主要参与磷酸盐的转运,在植物生长发育中起重要作用.为研究小麦PHO基因家族成员的潜在功能,本研究从小麦全基因组中鉴定PHO基因家族成员,并利用生物信息学手段对其基因结构特征、蛋白结构域、系统进化、顺式作用元件及表达特性进行分析.结果在小麦全基因组中共鉴定到12个PHO基因家族成员,所有成员均含有SPX和EXS结构域.系统进化、保守结构域和基因结构分析发现,小麦PHO蛋白与拟南芥PHO1-H1蛋白以及水稻PHO1蛋白亲缘关系较近;除TaPHO7、TaPHO10、TaPHO11和TaPHO12蛋白缺少部分基序外,其余小麦PHO蛋白均具有完整基序,且同一亚组内的成员具有相似的蛋白保守结构域和基因结构,说明PHO亚家族成员间高度保守.顺式作用元件分析发现,小麦PHO基因启动子区域含有与磷调控相关的激素诱导、光响应、低温响应等元件.基于RNA_seq数据的组织特异性分析发现,大部分PHO基因在根中的表达量较高.qRT-PCR分析发现,低磷胁迫处理下磷高效小麦品种小偃54地下部分(根)TaPHO7和TaPHO8基因的表达量显著高于对照.

分类号： S512.1%S330

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