273份水稻种质资源的遗传多样性、群体结构与连锁不平衡分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 董俊杰

作者： 董俊杰;曾宇翔;季芝娟;梁燕;杨长登

作者机构：

关键词： 水稻种质资源;遗传多样性;群体结构;连锁不平衡

期刊名称： 中国水稻科学

ISSN：

年卷期： 2021 年 002 期

页码： 130-140

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】评估273份水稻种质资源的遗传多样性和群体结构,为今后利用这些水稻种质资源进行遗传育种和关联分析提供参考。【方法】利用214个分子标记对来自14个国家的273份水稻地方品种和育种材料进行基因型检测,分析其遗传多样性、群体结构、连锁不平衡程度。【结果】群体结构分析将供试群体划分为2个亚群（SG1、SG2）以及1个混合群（AD）,聚类分析和主成分分析结果与群体结构分析结果一致;遗传多样性分析结果显示,214个标记共检测到524个等位变异,变幅为2～5个,平均遗传多样性指数为0.44,平均多态性信息含量（PIC）为0.355,SG2群遗传多样性指数和PIC高于SG1群;分子方差分析表明34%的变异来源于种群内,66%的变异来源于种群间,SG1与SG2群体间存在显著的遗传分化(Fst=0.725,P<0.01);连锁不平衡分析结果显示,整个群体中存在较高程度连锁不平衡,平均r2为0.33,SG1和SG2中连锁不平衡衰减到75%以下所延伸的最小距离分别为13.7 Mb和90.5 kb。【结论】273份水稻种质资源群体内具有丰富的遗传变异,该群体适合通过关联作图来挖掘优异等位基因。

分类号： S511

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