基因组选择信号揭示西×荷杂交牛杂种优势相关基因

文献类型： 中文期刊

第一作者： 范婷婷

作者： 范婷婷;马毅;王兢;赵国耀;徐凌洋;陈燕;张路培;高会江;李俊雅;高雪

作者机构：

关键词： 全基因组;选择信号;杂种优势

期刊名称： 中国畜禽种业

ISSN： 1673-4556

年卷期： 2023 年 07 期

页码： 9-18+1

摘要： 为探究德系西门塔尔牛与荷斯坦牛的杂种优势，挖掘与杂种优势相关的候选基因，解析牛杂种优势的遗传机制。该研究选择系谱信息清晰的德系西门塔尔牛（父本）、荷斯坦牛（母本）及其杂交F_1代共91头个体，利用Illumina Bovine GGP100K高密度芯片进行基因分型，基于群体分化系数Fst对其开展研究，鉴定杂种优势相关基因。结果表明，F_1代与德系西门塔尔牛（父本） Fst分析发现，在全基因组水平Top 1%的阈值内，检测到859个SNPs位点区域Fst值>0.19，注释到候选基因249个；与荷斯坦牛（母本）的Fst分析，发现有860个SNPs位点区域Fst值>0.15，注释到261个候选基因。基因Pathway富集分析发现，F_1代与父本间受到选择的基因主要富集在轴突引导通路（P<0.01）；与母本间受到选择的基因主要富集在灶性粘连和催乳素信号通路（P<0.05），这些通路上的基因可能对杂交后代杂种优势的产生具有较大的影响。对F_1代与父本、母本共同受到选择的SNPs位点进行定位与注释，鉴定发现共有38个与牛生长发育、产奶、肉质、胴体、繁殖等性状相关的基因，如OXTR、 CHKA、PRKN等。结果表明这些基因可能为西×荷杂交牛杂种优势相关基因，并为西荷杂种优势利用提供了参考依据。

分类号： S823

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