棉纤维伸长阶段上、下调基因及相关通路的分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 贾银华

作者： 贾银华;杜雄明

作者机构：

关键词： 基因通路图;脂肪酸;cDNA芯片

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2010 年 36 卷 11 期

页码： 1891-1901

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 棉花纤维细胞是研究细胞发育机制的理想材料,陆地棉Ligon lintless(Li1)是单基因显性超短纤维突变体,其性状表现为长纤维极度缩短,分离得到的野生型(li1)纤维发育正常。本实验通过cDNA芯片的方法对2个材料进行比较分析,采集开花前1d到开花后7d材料,检测到多个上调和下调基因,选择2个基因(CIPK和XET)进行RT-PCR和qRT-PCR的芯片验证。应用MAS(molecular analysis system)系统进行GO功能注释和Pathway的分析表明,这些差异表达基因参与脂肪酸代谢(fatty acid metabolism)、甘油脂代谢(glycerolipid metabolism)以及碳固定(reductive carboxylate cycle)等多个代谢途径。这些基因在突变体Li1中的异常表达可能导致细胞中脂肪酸和脂肪含量变化,影响棉纤维细胞的正常发育。

分类号： S562

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