陆地棉GhDHN1基因结构及内含子生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王俊娟

作者： 王俊娟;郭丽雪;陆许可;阴祖军;王德龙;陈修贵;王帅;樊伟丽;陈超;叶武威

作者机构：

关键词： 陆地棉;脱水素基因GhDHN1;基因结构;内含子;生物信息学分析

期刊名称： 中国棉花

ISSN： 1000-632X

年卷期： 2018 年 06 期

页码： 10-11+28

摘要： 利用生物信息学方法分析陆地棉脱水素基因GhDHN1的DNA序列结构特性,预测其功能。序列分析表明,GhDHN1基因的基因组DNA中AT碱基含量为52.16%,而内含子具有较高的AT碱基含量(63.33%);GhDHN1基因不含CpG岛;其内含子序列含有核心启动子元件TATA框、启动子的增强子元件CAAT框,并含有参与光响应的保守DNA模块的部分元件(Box4)、赤霉素响应元件GARE-motif、生长素响应元件TGA元件等,说明该内含子可能参与了该基因的转录活动,可能受光、激素的诱导;GhDHN1内含子具有GT-AG规则的保守序列,推测GhDHN1基因具有保守的内含子剪接机制。

分类号： S562

  • 相关文献

[1]陆地棉脱水素基因GhDHN1与拟南芥AtCOR47基因的比较. 王俊娟,王俊娟,陆许可,郭丽雪,阴祖军,王德龙,陈修贵,王帅,樊伟丽,陈超,叶武威. 2018

[2]棉花DNA甲基转移酶GhDMT9抗逆性分析. 杨笑敏,杨笑敏,芮存,张悦新,王德龙,王俊娟,陆许可,陈修贵,郭丽雪,王帅,陈超,叶武威. 2019

[3]棉花GhUGT75L6的生物信息学分析及功能验证. 王心蕾,王心蕾,陆许可,陈修贵,王俊娟,王德龙,王帅,郭丽雪,陈超,叶武威. 2021

[4]棉花GhDMT3的功能验证及生物信息学分析. 叶武威,叶武威. 2019

[5]陆地棉GhPKE1的生物信息学分析及功能验证. 王琴琴,陈修贵,陆许可,王帅,张悦新,范亚朋,陈全家,叶武威. 2022

[6]陆地棉GhPYR1基因的克隆和功能分析. 刘妍,孟志刚,孙国清,王远,周焘,郭三堆,张锐. 2016

[7]陆地棉低磷胁迫应答基因GhGDPD1的克隆与表达分析. 孟超敏,耿翡翡,卿桂霞,张富厚,李雪林,刘逢举. 2023

[8]陆地棉膜结合脂肪酸去饱和酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 陈义珍,李浩,傅明川,王立国,刘任重,柳展基. 2023

[9]牦牛IGF2内含子的遗传多态性及其遗传效应分析. 王丁科,阎萍,梁春年,曾玉峰,裴杰. 2009

[10]大珠母贝(Pinctada maxima)α-淀粉酶基因cDNA及内含子克隆分析. 潘俐玲,黄桂菊,成书营,王晓宁,喻达辉. 2013

[11]植物基因组内含子与mRNA相互作用的保守性特征. 张强,赵小庆,薄素玲,曹艳娟,苏文霞. 2021

[12]mRNA序列与相应UTR中内含子序列的相互作用. 张强,赵小庆,薄素玲,曹艳娟,苏文霞. 2020

[13]线虫核糖核蛋白基因外显子连接序列与其内含子的相互作用. 张强,赵小庆,薄素玲,曹艳娟,苏文霞. 2020

[14]海南黑山羊PRLR内含子Ⅰ和Ⅱ多态性与产羔数的相关分析. 郑心力,王峰,孙瑞萍,黄丽丽,晁哲,魏立民. 2012

[15]棉铃虫不同品系Gqα基因的比较及其原核表达与纯化. 王桂荣,吴孔明,张永军,梁革梅,郭予元. 2010

[16]转Xa21基因水稻抗优97特异性检测方法的建立. 王锡锋,彭于发. 2006

[17]猪食道口线虫MSP基因的克隆及序列分析. 林瑞庆,张媛,宋慧群,袁子国,朱兴全. 2011

[18]内含子数量改变GUS基因的瞬时表达调控. 关峰,韦正乙,王云鹏,林春晶,邢少辰,马景勇. 2011

[19]大口黑鲈IGF-I基因内含子1、3和4序列多态性研究. 李小慧,白俊杰,叶星,胡隐昌. 2009

[20]Q型烟粉虱扬州种群cyp6cm1基因内含子抗性相关多态性检测及其5′侧翼序列克隆. 袁林泽,王少丽,王文龙,杜予州,张友军,王建军. 2015

作者其他论文 更多>>

微信小程序