栽培种花生EST-SSR引物的开发及应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 肖洋

作者： 肖洋;廖伯寿;晏立英;黄家权;任小平;雷永;姜慧芳

作者机构： 中国农业科学院油料作物研究所/油料作物生物学重点开放实验室

关键词： 花生;EST-SSR;标记开发

期刊名称： 湖北农业科学

ISSN： 0439-8114

年卷期： 2010 年 49 卷 11 期

页码： 2625-2628

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 从高油抗青枯病花生新品系"06-4104"构建的5个cDNA文库获得了63207条EST,经序列拼接,获得14547条Uni-EST。经MISA检索,在这些Uni-EST中共检测出2643个SSR位点,分布于2250条EST中,发生频率为15.5%,平均每3.1kbEST序列含有一个SSR位点。其中,三核苷酸重复类型出现频率最高,占SSR总数的49.1%,其次是二核苷酸重复类型,占SSR总数的45.8%。在发现的46类重复基序中,AG/TC重复基序的频率最高,AAG/TTC次之。利用Primer3从含有SSR的2250条EST中共设计引物100对,利用这些引物检测花生栽培品种的多态性。结果表明,在所设计的100对引物中有91对在供试的6个花生栽培品种中得到有效扩增,其中13对得到了多态性的扩增产物,每对引物检测出的等位基因数2～3个,平均2.2个。

分类号： S565.2

  • 相关文献

[1]棉花EST-SSR新标记特征及其遗传多样性分析. 梁维维,张大伟,陈全家,曲延英,高文伟. 2013

[2]紫苏EST-SSR分布特征及标记开发. 张天缘,宋莉,沈奇. 2017

[3]药用植物苦参EST-SSR标记的开发及DNA指纹图谱的构建. 段永红,雷海英,张旭,吴玉香,孙毅. 2018

[4]白花草木樨EST-SSR标记的开发与筛选. 剡转转,任艳,吴凡,骆凯,张代玉,闫启,张宇飞,赵玉凤,张吉宇. 2017

[5]南瓜属EST-SSR标记的开发及在杂种纯度鉴定中的应用. 张国裕,张帆,姜立纲,翟伟卜,李海真. 2011

[6]圭亚那柱花草新EST-SSR标记验证及其在柱花草属上的转移. 丁西朋,罗小燕,贾庆麟,白昌军. 2015

[7]大白菜EST-SSR标记开发中非SSR标记的鉴别. 周新成,刘立峰,李化银,高建伟. 2010

[8]川芎转录组SSR分析与EST-SSR标记的开发. 彭芳,杨泽茂,钟文娟,牟方生,龚一耘,戢沛城,蒲德强,黄海燕,杨晓,张超. 2017

[9]草莓EST-SSR标记的开发与应用. 王静,赵密珍,于红梅,王壮伟. 2011

[10]甘蓝EST-SSR标记的开发与应用. 陈琛,庄木,李康宁,刘玉梅,杨丽梅,张扬勇,程斐,孙培田,方智远. 2010

[11]辣椒EST-SSRs分布特征及其应用. 支莉,王述彬,刁卫平,刘金兵,潘宝贵,戈伟,于彩云. 2010

[12]辣椒EST-SSR标记的开发与验证. 李永平,林珲,康建坂,温庆放. 2016

[13]花生SSR分子标记的开发与利用. 王金彦,杨庆利,禹山林. 2009

[14]NCBI和cDNA文库中栽培花生EST-SSR分子标记的开发及其特点(英文). 王金彦,潘丽娟,杨庆利,禹山林. 2009

[15]海蓬子属植物EST序列的SSR信息分析与标记开发. 黄益洪,张强,张大勇,徐照龙,许玲,刘晓庆,何晓兰,马鸿翔. 2013

[16]玉米分子标记辅助育种及标记开发研究进展. 陈秀华,于丽娟,罗黎明,陈洪梅,刘丽. 2016

[17]马铃薯块茎形状CAPS标记的开发与验证. 朱文文,徐建飞,李广存,段绍光,刘杰,卞春松,庞万福,WalterDeJong,金黎平. 2015

[18]木薯块根肉质颜色基因CAPS标记的开发与验证. 周慧文,严华兵,肖亮,陈新. 2018

[19]基于菊芋转录组的SSR分子标记开发及鉴定. 杨世鹏,孙雪梅,王丽慧,高洁铭,李莉,田洁,赵孟良,钟启文. 2018

[20]大菱鲆(Scophthalmus maximus)微卫星序列的开发与分析. 李猛,马爱军,岳亮,邹杰,王广宁,田岳强,马本贺,夏丹丹. 2013

作者其他论文 更多>>

微信小程序