陆地棉GhPKE1的生物信息学分析及功能验证
文献类型: 中文期刊
第一作者: 王琴琴
作者: 王琴琴;陈修贵;陆许可;王帅;张悦新;范亚朋;陈全家;叶武威
作者机构:
关键词: 陆地棉;GhPKE1;生物信息学分析;VIGS
期刊名称: 中国农业科技导报
ISSN: 1008-0864
年卷期: 2022 年 01 期
页码: 38-45
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为研究棉花重金属结构域基因GhPKE1在棉花中的作用,采用生物信息学方法对GhPKE1 DNA序列的结构特性及其编码蛋白质的理化性质、疏水性和蛋白二级结构等进行分析,并根据GhPKE1的结构特点构建了GhPKE1的病毒诱导基因沉默(VIGS)载体侵染棉花。结果表明,GhPKE1基因序列全长1 048 bp,蛋白质相对分子质量27.54 kD,等电点9.3,不稳定系数35.56。分别用硫酸钠(Na_2SO_4)和氯化镉(CdCl_2)胁迫处理沉默GhPKE1的三叶期棉苗,处理后植株表现出明显的表型差异。qRT-PCR表达模式分析表明,用pYL156:GhPKE1侵染过的棉花中GhPKE1转录水平与对照相比显著降低;与对照相比,沉默GhPKE1棉花幼苗的抗Na_2SO_4和抗CdCl_2性显著减弱。综上所述,GhPKE1基因在棉花响应逆境胁迫过程中发挥重要作用,为进一步研究棉花的抗逆机制奠定基础。
分类号: S562
- 相关文献
[1]陆地棉COR基因在低温胁迫下的表达分析及功能鉴定. 李建平,足木热木·吐尔逊,郝晓燕,常晓春,高升旗,胡文冉,陈果,黄全生. 2020
[2]VIGS技术解析激素信号途径相关基因抗黄萎病功能. 刘凯,司宁,齐放军,张文蔚,简桂良. 2015
[3]月月粉TGAs基因结构及RcTGA2抗灰葡萄孢菌功能分析. 高鹏华,张颢,晏慧君,陈宇春,范元兰,鄢波,邱显钦. 2021
[4]棉花DNA甲基转移酶GhDMT9抗逆性分析. 杨笑敏,杨笑敏,芮存,张悦新,王德龙,王俊娟,陆许可,陈修贵,郭丽雪,王帅,陈超,叶武威. 2019
[5]棉花GhUGT75L6的生物信息学分析及功能验证. 王心蕾,王心蕾,陆许可,陈修贵,王俊娟,王德龙,王帅,郭丽雪,陈超,叶武威. 2021
[6]棉花GhDMT3的功能验证及生物信息学分析. 叶武威,叶武威. 2019
[7]陆地棉GhPYR1基因的克隆和功能分析. 刘妍,孟志刚,孙国清,王远,周焘,郭三堆,张锐. 2016
[8]陆地棉低磷胁迫应答基因GhGDPD1的克隆与表达分析. 孟超敏,耿翡翡,卿桂霞,张富厚,李雪林,刘逢举. 2023
[9]陆地棉GhDHN1基因结构及内含子生物信息学分析. 王俊娟,郭丽雪,陆许可,阴祖军,王德龙,陈修贵,王帅,樊伟丽,陈超,叶武威. 2018
[10]陆地棉膜结合脂肪酸去饱和酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 陈义珍,李浩,傅明川,王立国,刘任重,柳展基. 2023
[11]利用VIGS技术分析野生茄Ve基因的抗黄萎病功能. 刘军,周晓慧,冯翠,武文,庄勇. 2014
[12]病毒诱导的烟草DHS基因的沉默. 王宏芝,马荣才,李瑞芬,王国英,魏建华. 2005
[13]VIGS介导的番茄转录因子SIDREB2基因的耐旱特征. 于国红,马雪峰,徐娜,辛世超,程宪国. 2012
[14]棉花VIGS病毒载体的构建及其在抗病基因功能鉴定的应用. 李建平,郝晓燕,李琴,高升旗,常晓春,陈勋基,足木热木·吐尔逊,陈果,黄全生. 2018
[15]应用于茄子的病毒诱导的基因沉默体系的建立与优化. 刘军,杨艳,周晓慧,姜悬云,鲍生有,庄勇. 2018
[16]不同VIGS体系在棉花中沉默效率的研究. 吴洁,吴洁,刘帅,马晶晶,杨兆光,乔艳艳,赵沛,吴珍平,操宇琳,张朝军. 2021
[17]嫁接陆地棉查尔酮合成酶与查尔酮异构基因的克隆及表达分析. 宋成攀,夏松波,王孝刚,张教海,秦鸿德,张友昌,冯常辉,别墅. 2017
[18]辣椒抗黄瓜花叶病毒病候选基因功能鉴定. 张根莲,郭广君,潘宝贵,刁卫平,刘金兵,戈伟,王述彬. 2020
[19]双生病毒在生物技术中的应用. 杨秀玲,丁波,周雪平. 2016
[20]基于TRV病毒的工业大麻(Cannabis sativa L.)VIGS体系的优化. 刘俊飞,杨晓娟,潘根,郑建树,黄思齐. 2023
作者其他论文 更多>>
-
四翅滨藜在浙江省的生长适应性及其影响因素
作者:王湘洁;韩科峰;马正波;楼金;王帅;吴良欢
关键词:四翅滨藜;土壤改良;耐盐碱;适应性;新垦地
-
天津地区口感番茄设施栽培技术
作者:李海燕;付婷婷;李冰;王帅;杨晓玲;王丽
关键词:天津地区;口感番茄;设施;栽培技术
-
西藏地区藏羊隐孢子虫的分子流行病学调查
作者:孔皓月;张月玥;马平平;牟文杰;邹扬;郭亚琼;王帅;张少华
关键词:藏羊;隐孢子虫;基因亚型;人兽共患
-
根系木质素含量影响玉米耐盐性的机制研究
作者:张青云;马蕾;胥华;靳礼安;邹俊杰;王宝宝;陈全家;徐妙云
关键词:玉米;耐盐性;根系;细胞壁;木质素
-
肠道共生生物对肠道干细胞的调节机制研究进展
作者:丁莹莹;张嘉芸;唐龙轩;张少华;郭小腊;蒲丽霞;牟文杰;王帅
关键词:肠道菌群;肠道蠕虫;肠道干细胞
-
棉花发根农杆菌转化体系的建立及生根优化
作者:汪炜檬;魏云晓;唐云霓;刘苗苗;陈全家;邓晓娟;张锐
关键词:棉花;遗传转化;发根农杆菌;毛状根;基因编辑
-
花椒良种-丰彩花椒的选育
作者:李洪;彭先容;张义刚;冯蓉;卢明;赵敬坤;王帅;刘国瑞;范一逵
关键词:花椒良种;丰彩花椒;选育