陆地棉GhPKE1的生物信息学分析及功能验证
文献类型: 中文期刊
第一作者: 王琴琴
作者: 王琴琴;陈修贵;陆许可;王帅;张悦新;范亚朋;陈全家;叶武威
作者机构:
关键词: 陆地棉;GhPKE1;生物信息学分析;VIGS
期刊名称: 中国农业科技导报
ISSN: 1008-0864
年卷期: 2022 年 01 期
页码: 38-45
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为研究棉花重金属结构域基因GhPKE1在棉花中的作用,采用生物信息学方法对GhPKE1 DNA序列的结构特性及其编码蛋白质的理化性质、疏水性和蛋白二级结构等进行分析,并根据GhPKE1的结构特点构建了GhPKE1的病毒诱导基因沉默(VIGS)载体侵染棉花。结果表明,GhPKE1基因序列全长1 048 bp,蛋白质相对分子质量27.54 kD,等电点9.3,不稳定系数35.56。分别用硫酸钠(Na_2SO_4)和氯化镉(CdCl_2)胁迫处理沉默GhPKE1的三叶期棉苗,处理后植株表现出明显的表型差异。qRT-PCR表达模式分析表明,用pYL156:GhPKE1侵染过的棉花中GhPKE1转录水平与对照相比显著降低;与对照相比,沉默GhPKE1棉花幼苗的抗Na_2SO_4和抗CdCl_2性显著减弱。综上所述,GhPKE1基因在棉花响应逆境胁迫过程中发挥重要作用,为进一步研究棉花的抗逆机制奠定基础。
分类号: S562
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