文献类型： 中文期刊
第一作者： 刘昭
作者： 刘昭;高源;王昆;孙思邈;代瑛姿;路翔;田雯;王大江;冯建荣
作者机构：
关键词： 苹果;盐胁迫;miRNA;深度测序;生物信息学
期刊名称： 农业大数据学报
ISSN： 2096-6369
年卷期： 2024 年 6 卷 001 期
页码： 14-23
摘要： 土壤盐渍化已成为限制农作物产量与质量的重要因素之一,影响着全世界范围内的农作物产量.苹果作为一种重要的水果作物,盐胁迫的危害及耐盐砧木的缺乏已成为威胁现代苹果产业健康可持续发展的重要问题.因此,研究苹果对盐胁迫的反应和适应具有重要的现实意义和紧迫性.本研究分别以0%、0.2%和0.6%NaCl处理0、4、8和12天后的珠美海棠实生苗为试验材料,从叶片及根系中提取总RNA,构建RNA-seq文库,共鉴定获得575个miRNA,包括315个已知mdm-miRNA和260个新miRNA.此外,Differential Expression(DE)miRNA对盐胁迫反应具有组织特异性表达模式.同时提供珠美海棠miRNA深度测序的数据集,结合生物信息学方法对原始数据质量控制,获得高质量序列并利用BLAST软件将预测靶基因序列与NR、Swiss-Prot、Pfam等数据库比对,获得响应盐胁迫相关基因的注释信息.GO分析表明与盐胁迫有关miRNA及靶基因主要参与生物过程中对刺激的反应.本研究为珠美海棠的利用提供理论数据基础,并为耐盐砧木的选育提供有力支持.
分类号： S661.1
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