世界栽培豌豆(Pisum sativum L.)资源群体结构与遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 宗绪晓

作者： 宗绪晓;关建平;王海飞;马钰

作者机构：

关键词： 豌豆(Pisum sativum L.);种质资源;SSR;遗传多样性;群体结构;基因库

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2010 年 43 卷 02 期

页码： 240-251

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】评价国家种质库长期保存的国内外栽培豌豆(Pisum sativum L.)资源的遗传多样性水平,揭示其遗传多样性、等位基因和群体结构差异,据此评估其重要程度及价值,为中国豌豆资源研究策略和方向的正确选择、国内外资源的充分发掘利用和深入研究提供理论依据。【方法】利用21对豌豆多态性SSR引物,对来自国外五大洲66个国家和中国28个省(区、市)的1984份栽培豌豆进行SSR标记遗传多样性和群体结构分析;采用Structure2.2软件完成资源群体结构剖析、推断参试材料的合理组群数、确定每份参试材料的适当群体划入及其相关参数计算;利用NTSYSpc2.2d软件估算其遗传距离,进行主成分分析(PCA)并绘制三维空间聚类图;采用PopgeneV1.32估算种质群的等位位点分布等参数,利用FstatV2.9.3.2进行种质群间遗传多样性差异显著性测验。【结果】通过对国、内外栽培豌豆资源群间SSR等位基因数(NA)、有效等位基因数(NE)、有效等位基因所占比重(NE/NA)、等位基因丰度(AR)、基因多样性指数(GD)、Shannon's信息指数(I)的比较,发现除等位基因数(NA)外,国内资源的其它5个遗传多样性指标全面高于国外资源。在21个SSR基因位点中,国内、外资源群在7个位点间存在等位基因种类的差异。群体结构分析将1984份世界栽培豌豆资源划分成三大组群。组群A包含96.49%的国外栽培豌豆参试资源,可代表典型的国外栽培豌豆资源类型;组群B的资源88.18%来源于陕西和内蒙古,可代表中国典型的春播区栽培豌豆资源类型;组群C的资源52.05%源于中国秋播区,47.44%源于中国春播区,可代表中国秋播区和除陕西、内蒙古外的春播区栽培豌豆资源类型。组群间遗传多样性差异达到显著水平。PCA作图分析也明确显示世界栽培豌豆资源群体中存在3个边界明显的资源富集区(基因库I、II、III),且与三大组群的群体结构分析结果精确对应。【结论】国内资源的遗传多样性程度整体上超过国外资源,国外资源群体内个体间的差异程度平均高于国内资源。群体结构分析侦测到世界栽培豌豆资源中存在A、B、C共三大资源类群,类群间的遗传多样性差异达到了显著水平,且与PCA做图分析显示的3个边界明显的基因库间存在着精确对等关系:"类群A"几乎等同于"基因库I","类群B"几乎等同于"基因库II",而"类群C"几乎等同于"基因库III";基因库I由国外资源富集而成,基因库II由中国陕西和内蒙古资源富集而成,基因库III由中国秋播区资源和陕西、内蒙古以外的春播区资源富集而成,由此得出世界栽培豌豆由3个基因库构成的结论。国外栽培豌豆种质资源构成了"基因库I",国内栽培豌豆种质资源构成了"基因库II"和"基因库III",表明国内、外资源均很重要,但国内资源甚于国外。

分类号： S643.3

  • 相关文献

[1]世界栽培豌豆(PisumsativumL.)资源群体结构与遗传多样性分析. 宗绪晓,关建平,王海飞,马钰. 2010

[2]豌豆属(Pisum)SSR标记遗传多样性结构鉴别与分析. 宗绪晓,Rebecca Ford,Robert R Redden,关建平,王述民. 2009

[3]橄榄转录组SSR信息分析及分子标记开发与应用. 谢倩,张诗艳,江来,丁明月,刘玲玲,吴如健,陈清西. 2023

[4]引进陆地棉种质材料的遗传多样性、群体结构与连锁不平衡. 杨洋,马君,李波,胡文冉,王玉晶. 2015

[5]甘薯引进种SSR遗传多样性分析. 王娇,霍恺森,赵路宽,赵冬兰,唐君,陈艳丽,曹清河. 2018

[6]青藏高原青稞耐寒种质资源基于SSR标记的遗传多样性及群体结构分析. 巴桑玉珍,刘新春,付国勇,李东梅,王丹丹,强小林,冯宗云. 2017

[7]基于SSR分子标记的154份桃品种遗传多样性分析. 殷纪伟,韩贝贝,马莹雪,武星廷,徐振江,姜建福,陈昌文,韩瑞玺. 2023

[8]老芒麦遗传多样性分析及核心种质构建. 闫伟红,马玉宝,张晶然,王凯,孟庆伟. 2016

[9]新疆早熟陆地棉SSR标记遗传多样性及群体结构分析. 叶春秀,李全胜,李有忠,庄振刚,谢宗铭. 2015

[10]老芒麦遗传多样性分析及核心种质构建. 闫伟红,马玉宝,张晶然,王凯,孟庆伟. 2017

[11]青稞种质资源遗传多样性分析与核心种质群体的构建. 原红军,曾兴权,徐其君,王玉林,扎桑,尼玛扎西. 2018

[12]陆地棉SSR标记遗传多样性及其与农艺性状的关联分析. 郭志军,赵云雷,陈伟,李运海,王红梅,龚海燕,桑晓慧. 2014

[13]基于SSR标记的花菜类种质亲缘关系和群体遗传结构分析. 刘春晴,李光庆,姚雪琴,蔡杰,谢祝捷. 2018

[14]25个油棕SSR标记的开发及应用这些标记评估油棕资源的遗传多样性. 肖勇,杨耀东,夏薇,沈雁,雷新涛,马子龙. 2013

[15]甘薯引进种SSR遗传多样性分析. 王娇,霍恺森,赵路宽,赵冬兰,唐君,陈艳丽,曹清河. 2018

[16]苎麻自交纯合进度研究. 谭龙涛,喻春明,陈平,王延周,陈继康,温岚,郑建树,熊和平. 2014

[17]303份甘薯地方种SSR遗传多样性与群体结构分析. 王娇,戴习彬,唐君,赵冬兰,张安,周志林,曹清河. 2018

[18]基于SSR标记的甜菜种质资源遗传多样性及群体结构分析. 赵尚敏,李晓东,付增娟,鄂圆圆,张辉,王良,张自强,郑文哲,张必周,白晨,张惠忠. 2021

[19]俄罗斯远东及黑龙江省春小麦种质资源的遗传多样性. 马淑梅,张睿,孙岩,刘东军,郭怡璠,刘文林,宋凤英,杨淑萍,张举梅. 2014

[20]云南白莺山茶树种质资源遗传多样性及群体结构分析. 姜晓辉,李红建,李崇兴,陈栋,方开星,秦丹丹,吴华玲. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序