三穗鸭体尺与屠宰性状的全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 伍革民

作者： 伍革民;韩雪;吴松成;冯宇隆

作者机构：

关键词： 三穗鸭;全基因组关联分析;体尺性状;屠宰性状;候选基因

期刊名称： 河南农业科学

ISSN： 1004-3268

年卷期： 2025 年 54 卷 006 期

页码： 135-143

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了筛选出影响三穗鸭体尺和屠宰性状的遗传位点和功能基因，以655只160日龄三穗鸭为研究对象，测定体尺（体斜长、颈长）和屠宰性状（宰前活质量、屠体质量、全净膛质量和胸腿肌率）等表型数据，通过全基因组关联分析（10×深度）获取个体单核苷酸多态性（SNP）基因型，基于PLINK 1.9进行质控分析，利用GEMMA执行混合线性模型关联分析，并通过clusterProfiler对显著关联位点进行KEGG候选基因功能富集分析。结果表明，分别筛选到与体斜长、颈长、宰前活质量、屠体质量、全净膛质量、胸腿肌率显著关联的SNP位点207、78、64、66、68、96个，分别注释到50、31、32、40、27、37个候选基因。KEGG富集分析结果表明，与体斜长、颈长、宰前活质量、屠体质量、全净膛质量和胸腿肌率关联的候选基因分别富集到16、10、12、11、13、22条KEGG通路。其中，神经活性配体-受体相互作用与6个性状均有关，钙信号通路与体斜长、屠体质量、全净膛质量和胸腿肌率有关，MAPK信号通路与宰前活质量、屠体质量和全净膛质量有关。LOC119717855、GPR50、GRM7、GABRB2、GABRG2、LOC101800857等基因是体斜长的关键候选基因，GRIK2、BNIP1等基因是颈长的关键候选基因，TAF2和NRK基因是宰前活质量、屠体质量和全净膛质量的关键候选基因，SLC8A1基因是屠体质量和全净膛质量的关键候选基因，HTR2A、QRFPR、NPVF和UTS2R等基因是胸腿肌率的关键候选基因。综上，影响三穗鸭体尺与屠宰性状的主要KEGG通路为神经活性配体-受体相互作用、钙信号等信号通路，关键候选基因为LOC119717855、GPR50、GRIK2、TAF2等。

分类号： S834

  • 相关文献

[1]三穗鸭体重与体尺性状间的相关性及多元回归分析. 韩雪,刘嘉,陶宇航,徐景峨,朱丽莉,蒲龄. 2021

[2]三穗鸭早期生长曲线拟合及10周龄体尺性状分析. 苗小猛,刘嘉,韩雪,李亮,周景瑞,吴仙,伍革民,张洁,徐景峨,蒲龄,陶宇航. 2020

[3]萧山鸡的体尺性状、屠宰性状测定及相关分析. 张军,卢立志,王继文,吕佳,杨福生,沈军达,陶争荣,王得前,田勇,任晋东,张聪聪. 2010

[4]福建白兔体尺性状与屠宰性状的典型相关分析. 陈冬金,陈岩锋,孙世坤,桑雷,王锦祥,谢喜平,兰扬生,林萍萍. 2020

[5]江汉鸡与隐性白羽肉鸡及其正反交后代体尺和屠宰性状比较研究. 申杰,黄涛,吴艳,皮劲松,潘爱銮,梁振华,孙静,张昊,蒲跃进. 2020

[6]蒙古雉鸡体尺和屠宰性状测定及相关性分析. 吴琼,袁红艳,宁浩然,宋超,邢秀梅. 2018

[7]白耳黄鸡体尺及屠宰性能的相关性分析. 祝碧琴,曾涛,李进军,占松华,刘兆合,沈军达,陶争荣,王德前,田勇,李国勤,黄爱霞,卢立志. 2012

[8]硒都黑猪屠宰和体尺性状的主成分分析和聚类分析. 李梓芃,王德才,张宇,谭国辉,孙华,乔木,梅书棋,彭先文. 2022

[9]2个品系肉鸡体尺性状和屠宰性状的典型相关分析. 赵振华,黎寿丰,黄华云,李春苗,张静,薛龙岗. 2012

[10]11个地方鸡品种性状间的典型相关分析. 吴信生,徐琪,肖小珺,张学余,吴圣龙,包文斌,李碧春,陈国宏. 2008

[11]湖羊屠宰性状和体尺性状的主成分分析和聚类分析. 黄举鹏,鲍晶晶,尚明玉,胡文萍,贺建宁,张莉. 2024

[12]肉鸡屠宰性状全基因组关联分析. 王一东,陈智武,黄超,粟永春,余洋,崔焕先,郑麦青,赵桂苹,文杰,王述柏. 2024

[13]全基因关联分析筛选文昌鸡体尺性状相关分子标记. 骆娜,安炳星,魏立民,文杰,赵桂苹. 2024

[14]吐鲁番黑羊体重和体尺性状全基因组关联分析. 白锋,玛尔孜娅·亚森,阿米妮古丽·阿不来孜,滕文,罗春彦,纳扎开提·艾尼万尔,张耘韬,纪新民,张艳花. 2025

[15]陆地棉自然群体纤维强度性状的全基因组关联分析. 贾冰,贾冰,马建江,宋吉坤,裴文锋,吴嫚,臧新山,张金发,陈全家,于霁雯. 2021

[16]小麦根部耐盐性状全基因组关联分析. 时晓磊,严勇亮,石书兵,王继庆,谢磊,张金波,耿洪伟. 2021

[17]南阳牛生长性状相关基因组区域全基因组关联分析. 吕世杰,陈付英,张子敬,施巧婷,辛晓玲,楚秋霞,李文军,柏中林,王二耀,徐照学. 2020

[18]代表性春大豆种质资源叶片蔗糖含量全基因组关联分析. 王象然,张大勇,郑伟,张振宇,徐杰飞,赵星棋,孙长恒,吴雨恒. 2024

[19]番茄抗旱性的全基因组关联分析. 董舒超,洪骏,凌嘉怡,谢紫欣,张胜军,赵丽萍,宋刘霞,王银磊,赵统敏. 2024

[20]基于全基因组关联分析揭示肉鸡腿病发生的遗传机制. 唐鑫鑫,郑炬梅,骆娜,营凡,朱丹,李森,刘大伟,安炳星,文杰,赵桂苹,李和刚. 2024

作者其他论文 更多>>

微信小程序