桃果实中MiR167a与其靶基因的鉴定及对IAA的响应分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 张彦苹
作者: 张彦苹;朱旭东;王晨;刘照坤;李庆魁
作者机构:
关键词: 桃;ppe-miR167a;靶基因;IAA;生长素信号
期刊名称: 西北植物学报
ISSN: 1000-4025
年卷期: 2021 年 41 卷 001 期
页码: 70-77
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 以‘小白凤’水蜜桃的果实为试材,利用miR-RACE技术验证了桃基因组中预测的ppe-miR167a的精确序列,克隆了预测的其3个ARFs靶基因PpARF6、PpARF8和PpARF6-like的ORF序列,并对预测靶基因进行了系统进化和保守结构域分析;同时降解组测序鉴定了ppe-miR167a的靶基因,并对二者间的作用模式及作用频度进行了分析.结果显示:(1)ppe-miR167a的精确序列与预测序列在5'和3'端均存在1个碱基的差异,预测的3个靶基因ARFs均含有高度保守的B3和生长素响应DNA结合域;系统进化树分析显示,桃中PpARF6、PpARF8及PpARF6-like均与巴旦杏的亲缘关系较近,其次为梅和甜樱桃.(2)降解组结果表明,预测的3个靶基因中,仅PpARF8能够被ppe-miR167a裂解,而未在PpARF6和PpARF6-like上检测到裂解位点.(3)外源IAA处理后,ppe-miR167a的表达量在处理组中低于对照组,而靶基因PpARF8及3'端裂解产物的表达均高于对照组.研究表明,桃果实中ppe-miR167a通过介导PpARF8的裂解影响生长素信号途径参与果实发育的调控.
分类号: Q785%Q786%Q789
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