基于MethylRAD-Seq技术对仿刺参DNA甲基化图谱的研究
文献类型: 中文期刊
第一作者: 李玉强
作者: 李玉强;王睿甲;李语丽;孙红振;李仰平;牟闯;吕佳;王师;包振民
作者机构:
关键词: DNA甲基化;MethylRAD;仿刺参
期刊名称: 中国海洋大学学报(自然科学版)
ISSN: 1672-5174
年卷期: 2018 年 09 期
页码: 41-50
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 全基因组DNA甲基化作为重要的表观遗传学现象,其在生物体诸多生理生化过程中起了重要作用。研究表明全基因组DNA甲基化在基因的表达调控、维持胚胎正常发育、染色体结构稳定等方面发挥了重要作用。DNA甲基化也成为当今的研究热点之一,目前在脊椎动物领域研究相对较多,但是对无脊椎动物的甲基化规律的研究比较匮乏,因此本研究以棘皮动物门中仿刺参作为研究对象,采用最新的全基因组DNA甲基化检测方法 MethylRAD-Seq技术探究了仿刺参三种组织的甲基化状况,得到了甲基化标签数量、甲基化位点分布以及甲基化标签密度等信息;此外通过整合仿刺参甲基化文库数据和表达谱数据发现基因甲基化水平与表达水平之间存在弱的正相关性,这暗示了无脊椎动物基因组DNA甲基化可能起到促进基因表达的作用。
分类号: S917.4
- 相关文献
[1]池塘养殖仿刺参(Apostichopus japonicus)肠含物、附着基和底泥中的菌群结构及其相关性. 李彬,廖梅杰,荣小军,张正,王印庚,陈贵平,王岚,范瑞用. 2016
[2]大连地区仿刺参养殖池塘叶绿素a分布和初级生产力估算. 姜北,薛克,周遵春,潘玉洲. 2010
[3]温度和溶解氧对仿刺参存活、代谢及运动能力的影响. 周晓梦,张秀梅,李文涛. 2018
[4]仿刺参(Apostichopus japonicus)中皂苷类成分的分离鉴定及细胞毒活性研究. 徐蕾,宋清平,杨爽,于明明,王远红,姜廷福,吕志华. 2018
[5]仿刺参养殖区泥样中灿烂弧菌拮抗菌的快速筛选及其保护作用. 陈四清,李杰,韩茵,唐磊,白海盟,刘长琳,邹安革,祁自忠. 2014
[6]仿刺参自然群体和养殖群体间遗传变异的微卫星标记研究. 谭杰,孙慧玲,刘萍,杨爱国,燕敬平,刘志鸿,周丽青. 2007
[7]仿刺参遗传多样性的RAPD分析. 谭杰,孙慧玲,刘萍,杨爱国,燕敬平,刘志鸿,周丽青. 2007
[8]仿刺参成参体腔细胞酚氧化酶的生化与酶学特性研究. 肖瑶,蒋经伟,李石磊,董颖,周遵春. 2021
[9]仿刺参硫酸软骨素合酶1基因克隆及灿烂弧菌感染后的表达特征模式分析. 谭颜廷,葛建龙,廖梅杰,荣小军,王锦锦,李彬,赵岩峰,王印庚,王璐. 2024
[10]仿刺参硫氧还蛋白基因在灿烂弧菌和鳗弧菌刺激下的应激表达特征. 吕新芳,孔令明,王学广,张晓雨,王文泉,杜宗军,李玉春. 2015
[11]3个仿刺参地理种群遗传变异的微卫星DNA分析. 谭杰,孙慧玲,刘萍,杨爱国,燕敬平,刘志鸿,周丽青. 2007
[12]中国仿刺参产业发展概况与全产业链质量安全潜在风险分析. 曹荣,张媛,杨敏,王联珠,刘淇. 2023
[13]微生态制剂对仿刺参室内育苗中换水频次的影响. 贾治超,于刚,秦传新,杨铿,杨莺莺,黄建华,白东清,刘雁. 2015
[14]养殖仿刺参霉菌病的病原初探. 张春云,陈国福,闫培生,徐仲,王印庚. 2010
[15]不同蛋白源饲料对仿刺参幼参体成分及消化酶活性的影响. 于建华,周玮,赵志刚. 2015
[16]仿刺参SARM基因的克隆、表达和功能研究. 孙红娟,陈仲,贺迪,高杉,王摆,关晓燕,蒋经伟,董颖,周遵春. 2021
[17]仿刺参幼体烂胃病及其致病原鉴定. 王印庚,孙素凤,荣小军. 2006
[18]仿刺参(Apostichopus japonicus)mtDNA三个基因片段的序列分析. 李颖,刘萍,孙慧玲,马甡,高天翔,王清印. 2006
[19]仿刺参夏眠前后池塘沉积物-水界面氮、磷通量研究. 王摆,高杉,周遵春. 2021
[20]地衣芽孢杆菌对仿刺参生长、消化和免疫功能的影响. 王旭达,关晓燕,王鉴,董颖,蒋经伟,姜北,李石磊,赵泽龙,陈仲,高杉,周遵春. 2021
作者其他论文 更多>>
-
爪哇棒束孢MSC-F1对柑橘全爪螨的毒力测定及液体发酵工艺优化
作者:杜丹超;刘顺民;蒲占湑;吕佳;鹿连明
关键词:爪哇棒束孢;发酵优化;生物防治;柑橘全爪螨;致死效果
-
基于16S rDNA扩增子分析柑橘黄龙病植株叶片中脉内生细菌菌群
作者:张利平;刘顺民;蒲占湑;朱莉;吕佳
关键词:柑橘黄龙病;16S rDNA;内生细菌
-
爪哇虫草MSC-f1的分离鉴定及其对多种柑橘害虫的毒力
作者:鹿连明;杜丹超;胡秀荣;蒲占湑;刘顺民;吕佳;黄振东;陈国庆
关键词:柑橘木虱;生防真菌;爪哇虫草;侵染过程;致病力
-
丘陵果园小型履带式农用底盘设计及有限元分析
作者:宫庆福;宋月鹏;马伟;高昂;李玉强;任龙龙
关键词:丘陵果园;农用动力底盘;稳定性分析;静力学分析;模态分析
-
基于全转录组测序的亚洲柑橘木虱激素生物合成相关基因互作网络构建
作者:朱莉;吕佳;黄振东;蒲占湑;刘顺民
关键词:亚洲柑橘木虱;发育;生殖;小RNA;长链非编码RNA;环状RNA
-
庆元县甜橘柚黄脉病发生情况调查研究
作者:练健俊;鹿连明;蒲占湑;吕佳;朱莉;吕佳;刘顺民
关键词:庆元甜橘柚;柑橘黄脉病毒;RT-PCR检测;调查
-
胶州湾滩涂生计渔业渔获物"蚝艮"的分类鉴定及其分布记录
作者:李昂;安长廷;李玉强;刘乐彬;柳淑芳;庄志猛
关键词:“蚝艮”;胶州湾;生计渔业;DNA条形码;物种鉴定;长体刺虾虎鱼
