基于SSR分子标记的裸花紫珠种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张红瑞

作者： 张红瑞;李鑫;陈振夏;胡文斌;李伟;黄梅;于福来;杨林立

作者机构：

关键词： 裸花紫珠;SSR分子标记;遗传多样性;遗传距离;聚类分析;主坐标分析;DNA指纹图谱

期刊名称： 中草药

ISSN：

年卷期： 2023 年 012 期

页码： 3971-3982

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 目的 研究裸花紫珠Callicarpa nudiflora种质资源遗传多样性，为其种质资源鉴定及优异种质筛选提供依据。方法 采用SSR分子标记技术，探究103份裸花紫珠种质遗传多样性，基于遗传距离进行UPGMA聚类分析，以SSR扩增条带为基础建立供试材料扩增条带DNA指纹图谱。结果 14对引物共扩增出92个等位基因（number of alleles,Na），有效等位基因（effective number of alleles,Ne）占比39.37%。平均多态性信息含量（polymorphism information content,PIC）为0.468 2,6对引物具有高度多态性（PIC＞0.5）,6对具有中度多态性（0.25＜PIC＜0.5）。平均Nei多样性指数（Nei’s gene diversity index,H）和Shannon指数（Shannon’s information index,Ⅰ）分别为1.039 0、0.505 1，表现出较高的遗传多样性水平。聚类分析将材料分为2大类：类群Ⅰ包括2份种质；类群Ⅱ包含101份种质，并分为2个亚类。主坐标分析将材料分为3个类群，与聚类结果基本一致。构建的指纹图谱通过引物组合能较好地将种质进行区分。结论 103份裸花紫珠种质具有丰富的遗传多样性，并成功利用14对SSR引物构建裸花紫珠种质DNA指纹图谱，可为裸花紫珠种质鉴定、亲缘关系以及分子辅助育种提供科学依据。

分类号： S567.19

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