基于SSR分子标记的裸花紫珠种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张红瑞

作者： 张红瑞;李鑫;陈振夏;胡文斌;李伟;黄梅;于福来;杨林立

作者机构：

关键词： 裸花紫珠;SSR分子标记;遗传多样性;遗传距离;聚类分析;主坐标分析;DNA指纹图谱

期刊名称： 中草药

ISSN：

年卷期： 2023 年 012 期

页码： 3971-3982

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 目的 研究裸花紫珠Callicarpa nudiflora种质资源遗传多样性，为其种质资源鉴定及优异种质筛选提供依据。方法 采用SSR分子标记技术，探究103份裸花紫珠种质遗传多样性，基于遗传距离进行UPGMA聚类分析，以SSR扩增条带为基础建立供试材料扩增条带DNA指纹图谱。结果 14对引物共扩增出92个等位基因（number of alleles,Na），有效等位基因（effective number of alleles,Ne）占比39.37%。平均多态性信息含量（polymorphism information content,PIC）为0.468 2,6对引物具有高度多态性（PIC＞0.5）,6对具有中度多态性（0.25＜PIC＜0.5）。平均Nei多样性指数（Nei’s gene diversity index,H）和Shannon指数（Shannon’s information index,Ⅰ）分别为1.039 0、0.505 1，表现出较高的遗传多样性水平。聚类分析将材料分为2大类：类群Ⅰ包括2份种质；类群Ⅱ包含101份种质，并分为2个亚类。主坐标分析将材料分为3个类群，与聚类结果基本一致。构建的指纹图谱通过引物组合能较好地将种质进行区分。结论 103份裸花紫珠种质具有丰富的遗传多样性，并成功利用14对SSR引物构建裸花紫珠种质DNA指纹图谱，可为裸花紫珠种质鉴定、亲缘关系以及分子辅助育种提供科学依据。

分类号： S567.19

  • 相关文献

[1]酱香型白酒用糯高粱种质遗传多样性分析. 肖松,周棱波,张国兵,邵明波,乙引,张立异. 2016

[2]基于SSR标记的苔草种质遗传多样性分析. 刘凌云,范希峰,滕珂,韩朝,温海峰,张辉,滕文军,常智慧,武菊英. 2021

[3]中国野生白灵菇遗传多样性的SCoT分析. 赵梦然,陈强,黄晨阳,张金霞,邬向丽. 2012

[4]东北地区水稻区试新品种的DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析. 陈英华,侯昱铭,李宏宇,李茂柏,袁媛,徐正进. 2009

[5]基于SSR标记新疆陆地棉的DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析. 王欣怡,李雪源,龚照龙,王俊铎,范李萍,郑巨云,梁亚军,郭江平,买买提·莫明,艾先涛. 2018

[6]安徽省各茶区茶树品系遗传多样性分析及指纹图谱构建. 阮旭,徐奕鼎,吴琼,刘丹丹,沈季雪,王雷刚,王文杰. 2020

[7]SSR分子标记技术在植物研究中的应用. 王玲玲,陈东亮,黄丛林,邢震. 2017

[8]江西省2009年水稻区试品种的DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析. 朱珊,黄仁良,孙娜,魏永清,张松繁,赵萍,贺国良,沈显华. 2010

[9]基于SSR标记的石榴品种遗传多样性分析和指纹图谱构建. 冯立娟,程云,王传增,焦其庆,尹燕雷. 2023

[10]扁蓿豆育成品系遗传多样性的RAPD研究. 赵丽丽,王照兰,杜建材,胡卉芳,李青丰,张彦艳. 2009

[11]芝麻核心收集品中育成品种(系)的遗传多样性分析. 车卓,张艳欣,孙建,张秀荣,尚勋武,王化俊. 2009

[12]利用SSR标记研究85个玉米自交系的遗传多样性. 孙友位,李明顺,张德贵,肖木辑,谢振江,李新海,谢传晓,郝转芳,张世煌. 2007

[13]咖啡种质资源遗传多样性的ISSR分析. 闫林,黄丽芳,王晓阳,孙燕,林兴军,董云萍,龙宇宙. 2019

[14]烤烟种质资源SSR核心引物的筛选及验证. 马冰,代帅帅,程亚增,蒋彩虹,任民,程立锐,杨爱国. 2016

[15]油菜自育与其他主栽品种的遗传多样性和遗传关系分析. 赵亚军,王灏,穆建新,赵卫国,李保军,任军荣,赵小萍,罗斌,于澄宇,栗茂腾. 2018

[16]辣椒种质遗传多样性的EST-SSR分析. 张竹青,邹学校. 2013

[17]基于SSR分子标记的油棕遗传多样性分析. 周丽霞,吴翼,肖勇. 2017

[18]50份无花果种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建. 卢立媛,阮树安,杨伟聪,刘晗琪,刘振盼,张永华,孙阳. 2024

[19]不同苹果品种白粉病田间抗性与遗传多样性分析. 郑伟,吴亚维,宋莎,罗昌国,王彬. 2023

[20]基于ISSR标记的猕猴桃品种遗传多样性分析及指纹图谱构建. 张安世,韩臣鹏,齐秀娟,张中海. 2017

作者其他论文 更多>>

微信小程序