双生病毒的同义密码子用法及其进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 徐晓忠

作者： 徐晓忠;刘庆坡;樊龙江;周雪平

作者机构：

关键词： 双生病毒;密码子用法;相对同义密码子使用频率;聚类分析;进化

期刊名称： 植物病理学报

ISSN： 0412-0914

年卷期： 2008 年 38 卷 05 期

页码： 478-488

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对双生病毒编码基因的变异进行了密码子用法分析,推测双生病毒基因的表达水平普遍不高,而外壳蛋白基因的表达水平相对较高,它们在密码子第3位上偏好使用A或T。双生病毒的密码子用法主要受到突变偏好和翻译选择等因素的影响。双生病毒的密码子使用具有基因特异性和一定程度的寄主特异性。基于相对同义密码子使用频率的聚类分析可以很好反映侵染单子叶植物和双子叶植物双生病毒之间的差异,也在一定程度上反映出双生病毒之间的亲缘关系。

分类号： S432.41

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