鸡肌肉发育相关miR-133c-3p靶基因筛选与鉴定
文献类型: 中文期刊
第一作者: 朱师良
作者: 朱师良;陈家磊;彭涵;熊霞;胡陈明;杨礼;宋小燕;夏波;余春林;邱莫寒;张增荣;杜龙环;汪江先;熊柱翔;杨朝武
作者机构:
关键词: 鸡;miR-133c-3p;生物信息学;基因表达量;肌肉生长发育;靶标验证
期刊名称: 中国农业大学学报
ISSN: 1007-4333
年卷期: 2025 年 30 卷 008 期
页码: 120-131
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 旨在研究鸡不同组织及骨骼肌卫星细胞中miR-133c-3p的表达情况,并利用生物信息学分析筛选其在胸肌中影响肌肉生长发育的关键靶基因。本研究利用在线网站预测鸡miR-133c-3p靶基因,进行GO和KEGG富集分析并构建蛋白-蛋白互作网络;利用在线公共数据库,分析胸肌相对于其他组织的miR-133c-3p表达量及筛选潜在靶基因,并通过双荧光素酶报告基因试验进行靶标验证。结果表明:1)预测获得103个靶基因;功能富集分析显示靶基因参与多种高分子化合物的合成与转运过程;并显著富集到肌动蛋白细胞骨架调控、mTOR等多条肌肉生长发育相关信号通路。2)PPI网络共筛选到5个Hub基因。3)miR-133c-3p仅在胸肌和心脏中表达,在胸肌中的表达量极显著高于心脏(P<0.01),且在卫星细胞增殖分化期间其表达水平呈先下降后上升的规律。4)共筛选到SGK1、MYH9、KLF7和NFAT5 4个靶基因。5)双荧光素酶报告基因检测发现miR-133c-3p与NFAT5存在靶标关系。综上,鸡miR-133c-3p在胸肌中可通过靶向NFAT5间接调控肌肉生长发育。本研究为解析鸡miR-133c-3p的功能及其分子机制提供了参考和依据。
分类号: S831
- 相关文献
[1]鸡肌肉发育相关miR
[2]鸡miR-133a-3p的表达、生物信息学分析及其靶基因初筛. 余春莲,朱师良,杨炜蓉. 2024
[3]miR-18a-5p在鸡不同生长时期的表达及其生物信息学分析与靶基因预测. 黄正洋,黄华云,穆春宇,李春苗,王钱保,黎寿丰,赵振华. 2021
[4]鸡堆型艾美耳球虫新基因的克隆与生物信息学分析. 阎晓菲,黄兵,韩红玉,杨斌,岳城,赵其平,姜连连,董辉. 2014
[5]几个地方鸡种MHCB-G座位克隆与生物信息学分析. 屠云洁,苏一军,张学余,李国辉. 2012
[6]鸡肠炎沙门菌毒力蛋白SipD生物信息学分析及原核表达. 原亮,韩晓玺,巩颖超,樊夏楠,郝蓓莉,郝双双,李昌文,常轶聪,李睿,刘芳萍. 2024
[7]鸡MOB基因的克隆与表达谱分析. 于晓龙,金洪洲,李响,满朝来. 2009
[8]江西2个地方鸡品种MHC B-G座位多态性及生物信息学分析. 屠云洁,苏一军,李国辉,张学余,殷建玫. 2013
[9]鸡抗菌肽NK-lysin的生物信息学分析. 杭柏林,李杰,张慧辉,徐彦召,徐军. 2017
[10]鸡6个功能基因microRNA靶标区域SNP的生物信息学预测. 耿立英,张传生,杜立新. 2008
[11]鸡PLA2G7基因编码蛋白的结构分析. 吴铭茵,谢璐,何静怡,陈钰婷,谢春琳,罗成龙,计坚. 2025
[12]肌肉发育相关 LncRNA 的研究进展. 魏彩虹,吴明明,刘瑞凿,赵福平,张莉,杜立新. 2014
[13]肌肉发育相关LncRNA的研究进展. 魏彩虹,吴明明,刘瑞凿,赵福平,张莉,杜立新. 2014
[14]半滑舌鳎雌、雄鱼myostatin基因差异表达的初步研究. 张梦倩,崔忠凯,陈张帆,徐文腾,陈松林. 2022
[15]牦牛MYL3基因的克隆及组织表达分析. 张梦帆,路建卫,扎老,赵雪,梁春年. 2024
[16]基于转录组分析对中国对虾Myostatin基因调控的肌肉生长相关基因的筛选. 闫允君,卢霞,孟宪红,栾生,陈宝龙,孔杰. 2021
[17]冠突散囊菌不同生长阶段MAT基因的表达量变化. 葛永怡,吴石平,谭玉梅,刘永翔,刘作易. 2015
[18]苜蓿雄性不育系MS-4 SSH文库构建及基因表达分析. 高翠萍,石凤翎,伊风艳,唐芳,赵彦,蔡丽艳. 2017
[19]棉花赤霉素合成酶基因在中571的差异表达研究. 石建斌,石建斌,王宁,周红,许庆华,乔文青,严根土. 2018
[20]蒙古马突触融合蛋白17(STX17)基因多态性及在不同毛色皮肤组织中的表达分析. 李蓓,何小龙,芒来. 2011
作者其他论文 更多>>
-
车前草多糖对黄羽肉鸡生长发育和盲肠微生物的影响
作者:陈家磊;余春林;彭涵;杨礼;胡陈明;熊霞;朱师良;张增荣;邱莫寒;夏波;宋小燕;熊柱翔;汪江先;杜龙环;杨朝武
关键词:车前草多糖;黄羽肉鸡;生长性能;免疫功能;盲肠微生物
-
羌山云朵鸡肉品质分析
作者:李荣宏;吴锦波;杨小林;余春林;王蓉芳;苏元君;李星亮;牟桑;张燕;张强;王扎
关键词:羌山云朵鸡;肉质;营养成分
-
胚蛋给养维生素E在家禽生产上的应用
作者:夏波;杨朝武;余春林;邱莫寒;张增荣;杨礼;宋小燕;熊霞
关键词:胚蛋给养;维生素E;孵化性能;雏鸡质量
-
乡城藏鸡发展现状、问题及对策
作者:张增荣;余春林;谢英;邱莫寒;朱师良;胡陈明;杨朝武
关键词:
-
不同菌种对鸡粪罐式发酵效果的影响
作者:王万霞;王斌;张增荣;余春林;李翔;李雯;杨朝武;胡陈明
关键词:鸡粪;罐式发酵;芽孢杆菌;光合菌;放线菌;酵母菌;乳酸菌
-
虚拟经颈静脉肝内门体分流术:个性化门脉高压治疗的数值模拟方法
作者:熊柱翔;余春林;杨朝武;郑庭辉
关键词:
-
人工上升流装置综述
作者:刘家成;雷鹏;黄筱云;夏波
关键词:渔业;水库养殖;人工上升流;综述
