鸡Fnip1基因克隆、组织表达及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 黄正洋

作者： 黄正洋;孔令琳;王钱保;李春苗;吴兆林;黄华云;赵振华

作者机构：

关键词： 鸡;Fnip1;基因克隆;表达分析;生物信息学分析

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2025 年 41 卷 001 期

页码： 119-125

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了明确鸡卵泡素相互作用蛋白1基因(Fnip1)特征及其表达规律，本研究选择苏禽3号黄羽肉鸡为试验材料，运用分子克隆技术扩增了鸡Fnip1基因CDS区序列全长，对其序列特性进行了生物信息学分析，构建了系统进化树；利用RT-qPCR方法检测了Fnip1基因在鸡不同组织中的表达。结果获得鸡Fnip1基因CDS区，序列开放阅读框为3 474 bp,位于第13号染色体16 191 415 bp至16 251 731 bp之间，编码1 157个氨基酸。生物信息学分析结果显示，Fnip1基因有20个外显子，FNIP1蛋白含有FNIP＿N、FNIP＿M和FNIP＿C等3个结构域；进化树显示，鸡先与鸟类聚为一类，再与哺乳动物聚为一支，在禽类上序列保守。FNIP1蛋白为亲水性蛋白，相对分子量为128 310,理论等电点为5.25。蛋白质二级结构由α-螺旋(34.40%)、β-折叠(4.06%)、延伸链(13.74%)、无规则卷曲(47.80%)组成。表达分析结果显示，Fnip1基因在鸡的胸肌和腿肌中表达量显著高于其他组织。综上所述，本研究获得了鸡Fnip1基因CDS区序列全长，发现其在鸡肌肉组织中有较高表达。本研究结果可为进一步研究Fnip1基因在鸡肌肉生长发育中的分子机制研究奠定数据支撑。

分类号： S831

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