宏基因组学方法分析奶牛瘤胃尿素分解菌的多样性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵圣国

作者： 赵圣国;王加启;刘开朗;李旦;于萍

作者机构：

关键词： 脲酶;尿素分解菌;多样性;宏基因组学;16S rDNA;ureC

期刊名称： 中国农业大学学报

ISSN： 1007-4333

年卷期： 2010 年 15 卷 01 期

页码： 61-67

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用脲酶保守序列ureC引物和细菌16S rDNA通用引物PCR扩增并测序,揭示奶牛瘤胃尿素分解菌的多样性。提取本研究室前期鉴定的16个脲酶克隆的质粒,利用脲酶保守序列ureC引物和细菌16S rDNA通用引物进行PCR扩增,将PCR产物连接到pMD19-T载体,转化E.coliJM109,挑取阳性克隆测序。利用Blast程序将序列与GenBank和RDP数据库进行比对,并使用Mega 4.0软件构建系统发育树。4个脲酶克隆含有脲酶保守序列ureC,系统发育树分析表明,U1、U5、U13和U15分别属于Firmicutes、ε-Proteobacteria、β-Proteobacteria和Actinobacteria;7个脲酶克隆含有16S rDNA,经过建树分析,U1、U3、U7、U10、U11、U12和U14分别属于Staphylococcus、Shigella、Bacillus、Acinetobacter、Achromobacter、未培养微生物和Bacillales。实验结果显示,奶牛瘤胃微生物脲酶基因和尿素分解菌具有多样性的特点。

分类号： S852.6

  • 相关文献

[1]六个不同品种牛的瘤胃微生物群落的比较分析. 刘开朗,卜登攀,王加启,于萍,李旦,赵圣国,贺云霞,魏宏阳,周凌云. 2009

[2]基于16S rDNA高通量测序技术分析湖北黑头羊瘤胃细菌的多样性. 索效军,杨前平,陶虎,熊琪,李晓锋,陈明新,张年. 2019

[3]紫云英根瘤茵的系统发育多样性*. 张晓霞,马晓彤,曹卫东,韦善君,蔡建辉,姜瑞波. 2010

[4]水牛乳中可培养乳酸菌多样性分析. 谢芳,杨承剑,杨小梅,唐艳,曾庆坤. 2017

[5]稻纵卷叶螟肠道细菌群落结构与多样性分析. 刘小改,杨亚军,廖秋菊,徐红星,刘映红,吕仲贤. 2016

[6]新疆两泥火山可培养中度嗜盐微生物多样性. 李智,杨红梅,张涛,徐赢华,徐建华,娄恺. 2010

[7]烟草秸秆还田对土壤细菌多样性的影响. 闫宁,郭东锋,姚忠达,窦玉青,刘新民,张忠锋. 2016

[8]羊粪低温沼气发酵细菌群落多样性分析. 代金平,陈竞,古丽·艾合买提,买尔哈巴,杨新平,冯蕾. 2016

[9]紫云英根瘤菌的系统发育多样性. 张晓霞,马晓彤,曹卫东,韦善君,蔡建辉. 2010

[10]瘤胃尿素分解菌及脲酶的分子特征与调控研究进展. 仲慧月,郑楠,王加启,赵圣国. 2023

[11]基于宏组学方法认识微生物群落及其功能. 马海霞,张丽丽,孙晓萌,张怀强,何明雄,陈冠军,王禄山. 2015

[12]古菌、生命树和真核细胞的功能演化. 肖静,范陆,吴顶峰,徐雁冰,赖登训,William F.MARTIN,朱瑞新,张传伦. 2019

[13]好氧堆肥微生物代谢多样性及其细菌群落结构. 王秀红,李欣欣,史向远,王保平,周静,籍增顺. 2018

[14]唾液乳杆菌SNK-6对新杨黑羽蛋鸡鸡蛋暗斑和肠道菌群的影响. 和笑笑,车培新,卫利春,卢奎,严华祥. 2020

[15]宏基因组学揭示鳗鲡养殖环境微生物抗性基因的赋存特征. 黄薇,廖茜,罗土炎,宋永康. 2020

[16]鳗鲡肠道微生物抗性基因组成特征的初步分析. 黄薇,刘兰英,罗土炎,刘洋,宋永康. 2020

[17]基于宏基因组学分析广西地区生水牛乳中嗜冷菌多样性. 赵利旦,黄丽,韦盘秋,黄加祥,曾庆坤,李玲. 2023

[18]半纤维素分解菌群HMC的微生物群落结构及功能. 高秀清,王琼,罗轶伦,吕育财,崔明宇,陈永伦,张冬冬,肖园,范淄亭,王浩伟,王轶,郭鹏. 2024

[19]宏基因组技术在开发未培养微生物资源中的应用. 李丽娟,张殿昌,龚世园. 2007

[20]凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)循环水养殖系统中养殖效果及菌群结构和功能研究. 唐亚鹏,董世瑞,田吉腾,周茜,王印庚,张天时. 2022

作者其他论文 更多>>

微信小程序