几个地方鸡种MHCB-G座位克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 屠云洁

作者： 屠云洁;苏一军;张学余;李国辉

作者机构：

关键词： MHC;克隆;生物信息学;鸡

期刊名称： 中国畜牧杂志

ISSN： 0258-7033

年卷期： 2012 年 48 卷 15 期

页码： 8-11

收录情况： 北大核心

摘要： 本研究利用PCR和克隆测序方法,克隆新狼山鸡和仙居鸡MHC B-G基因全序列,分析序列的多态性并预测其蛋白质的结构与功能,为更好地保护地方鸡种提供基础资料。结果表明:分别获得新狼山鸡和仙居鸡MHCB-G基因6 183 bp和6 415 bp全序列,与红色原鸡同源性达98%,3鸡种存在148个变异位点,为3个单倍型,单倍型多样度为0.07407,仙居鸡在4413-4661位置缺失249 bp;利用生物信息学预测新狼山鸡和仙居鸡MHCB-G蛋白,该蛋白具有丰富的B细胞抗原位点;新狼山鸡和仙居鸡有明显的跨膜螺旋结构,分别含有138个和98个磷酸化位点;MHC B-G基因具有丰富的遗传多样性,该MHC B-G蛋白可能是抗原位点的富集区,对其进化、抗原递呈作用以及疾病和生产性能的相关性发生重要影响。

分类号： S831.2

  • 相关文献

[1]鸡堆型艾美耳球虫新基因的克隆与生物信息学分析. 阎晓菲,黄兵,韩红玉,杨斌,岳城,赵其平,姜连连,董辉. 2014

[2]鸡MOB基因的克隆与表达谱分析. 于晓龙,金洪洲,李响,满朝来. 2009

[3]鸡MHC区域内微卫星LEI0258和MCW0312的遗传多态性. 金丽娜,韩建林. 2015

[4]狼山鸡保种群不同世代MHC BF基因遗传多样性研究. 屠云洁,束婧婷,苏一军,章明,姬改革,刘一帆,巨晓军,邹剑敏. 2018

[5]鸡MHC-B区域内复合微卫星LEI0258位点等位基因的序列变异. 万君兴,罗玉柱,韩建林. 2010

[6]9个地方鸡种MHC B-G座位多态性及其分子系统进化分析. 屠云洁,苏一军,王克华,张学余,李国辉,殷建玫. 2012

[7]大菱鲆MHCⅡB基因全长CDNA的克隆与组织表达分析. 张玉喜,陈松林. 2006

[8]大菱鲆(Scophthalmus maximus)MHCⅡA基因全长cDNA的克隆与组织表达分析. 张玉喜,陈松林. 2007

[9]miR-18a-5p在鸡不同生长时期的表达及其生物信息学分析与靶基因预测. 黄正洋,黄华云,穆春宇,李春苗,王钱保,黎寿丰,赵振华. 2021

[10]鸡肠炎沙门菌毒力蛋白SipD生物信息学分析及原核表达. 原亮,韩晓玺,巩颖超,樊夏楠,郝蓓莉,郝双双,李昌文,常轶聪,李睿,刘芳萍. 2024

[11]江西2个地方鸡品种MHC B-G座位多态性及生物信息学分析. 屠云洁,苏一军,李国辉,张学余,殷建玫. 2013

[12]鸡抗菌肽NK-lysin的生物信息学分析. 杭柏林,李杰,张慧辉,徐彦召,徐军. 2017

[13]鸡6个功能基因microRNA靶标区域SNP的生物信息学预测. 耿立英,张传生,杜立新. 2008

[14]鸡miR-133a-3p的表达、生物信息学分析及其靶基因初筛. 余春莲,朱师良,杨炜蓉. 2024

[15]鸡肌肉发育相关miR-133c-3p靶基因筛选与鉴定. 朱 师良,陈 家磊,彭 涵,熊 霞,胡 陈明,杨 礼,宋 小燕,夏 波,余 春林,邱 莫寒,张 增荣,杜 龙环,汪 江先,熊 柱翔,杨 朝武. 2025

[16]鸡肌肉发育相关miR-133c-3p靶基因筛选与鉴定. 朱师良,陈家磊,彭涵,熊霞,胡陈明,杨礼,宋小燕,夏波,余春林,邱莫寒,张增荣,杜龙环,汪江先,熊柱翔,杨朝武. 2025

[17]鸡PLA2G7基因编码蛋白的结构分析. 吴铭茵,谢璐,何静怡,陈钰婷,谢春琳,罗成龙,计坚. 2025

[18]鸡Cacna1s基因部分序列的克隆及分析. 张军,卢立志,王继文,吕佳,王得前,杨福生,沈军达,陶争荣,田勇,任晋东,张静. 2010

[19]清远麻鸡NALP3基因部分cDNA序列克隆及组织表达差异分析. 陶志云,施祖灏,朱春红,宋迟,徐文娟,宋卫涛,李慧芳. 2014

[20]鸡肉质鲜味特性相关基因的克隆及序列分析. 苏一军,季从亮,陈国宏,秦洁,束婧婷,张学余. 2005

作者其他论文 更多>>

微信小程序