茶树茎叶并联变异差异表达基因的WGCNA分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 翟秀明

作者: 翟秀明;李解;肖富良;唐敏;曾乐武;侯渝嘉;汤燚

作者机构:

关键词: 茶树;茎叶并联;转录组;WGCNA;关键基因

期刊名称: 茶叶科学

ISSN: 1000-369X

年卷期: 2025 年 45 卷 003 期

页码: 402-414

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 茶树茎叶并联突变是一种新型变异,是开发芽头茶、特异性茶产品以及食用观赏两用茶的优质材料。因此,研究茶树产生并联变异的原因,挖掘其关键控制基因,可为当前茶树育种多元化的需求提供新的靶点。以发生并联变异的茶树茎叶为研究材料,以正常茎叶为对照,采用石蜡切片的方法进行组织结构观察,并利用转录组测序技术、加权基因共表达网络分析(Weightedgeneco-expressionnetworkanalysis,WGCNA)技术,挖掘茶树发生茎叶并联现象的关键控制基因。组织结构观察结果表明,并联变异除了可以增加茶叶芽头数量,提高产量以外,还可有效增加茶树茎叶导管面积和导管数量,提升茶树光合能力及抗逆性。转录组测序研究发现,差异基因主要富集在ABC转运蛋白和植物与病原体相互作用两个通路上,分析挖掘关键基因9个。WGCNA共鉴定到26个共表达模块,挖掘性状相关特异性模块2个,筛选核心基因8个。这17个关键控制基因通过3种形式进行调控:ABCB(ATPbindingcassettesubfamilyB)和ABCC(ATPbindingcassettesubfamilyC)家族、RAC3(RAC familysmallGTPase3)、FKBP(FK506-bindingproteins)主要通过参与生长素、细胞分裂素等途径调控茶树新梢细胞分裂、分化;ABCG34(ATPbindingcassettesubfamilyG34)、CDPK2(Calcium-dependentprotein kina2)、 KCS2 (β-ketoacyl-CoAsynthase2)、 LAC11 (Laccase11)、 EP1 (Epidermis-specificsecreted glycoprotein1)、LTP(Lipidtransferprotei))等基因介导参与了茶树细胞壁中的纤维素、木质素、果胶等的生物合成,通过调控细胞壁的合成及延展方向等调节细胞形态发生,从而实现茶树茎、叶脉的并联分化;二甲基甲萘醌甲基转移酶以及组蛋白-赖氨酸N-甲基转移酶则通过DNA甲基化调控基因表达,最终导致茶树茎叶并联这一表观形态的发生。

分类号: S571.1

  • 相关文献

[1]基于转录组和WGCNA筛选丝瓜果长和果径发育调控相关基因. 陈敏氡,王彬,刘建汀,李永平,白昌辉,叶新如,裘波音,温庆放,朱海生. 2023

[2]基于WGCNA的甘蔗细胞壁建成和糖分积累调控网络分析. 颜宁,王茂瑶,李欣茹,沈银娟,李鸣,张木清,黄江锋. 2025

[3]感染"褐色沉积症"虾夷扇贝的外套膜转录组测序及差异表达基因分析. 于佐安,李大成,李华琳,刘项峰,滕炜鸣,刘忠颖,王庆志,周遵春. 2023

[4]黄秋葵果实质地变化的生化和转录组联合分析. 张国芹,牟建梅,陈虎根. 2023

[5]茶树叶片响应茶饼病侵染的转录组分析. 孙云南,许燕,冉隆珣,蒋会兵,宋维希,夏丽飞,陈林波,梁名志. 2020

[6]转录组测序分析外源水杨酸诱导茶树热激蛋白基因的响应. 刘悦,曲浩,田易萍,陈春林,冉隆珣,陈林波. 2024

[7]茶树花转录组微卫星分布特征. 王丽鸳,韦康,张成才,成浩. 2014

[8]基于RNA-Seq的雌蕊缺失茶树花转录组分析. 夏丽飞,陈林波,李梅,宋维希,田易萍. 2017

[9]植物激素对茶树春季新梢生长发育的调控作用研究. 李聪聪,王浩乾,叶玙璠,陈瑶,任恒泽,李宇腾,郝心愿,王新超,曹红利,岳川. 2023

[10]不同品种茶树新梢响应"倒春寒"的转录组分析. 王君雅,陈玮,刘丁丁,陈亮,姚明哲,马春雷. 2019

[11]茶树PPR基因家族全基因组鉴定及白化相关基因表达分析. 刘丁丁,王君雅,汤榕津,陈亮,马春雷. 2021

[12]基于RNA-Seq分析茶树新品系‘春绿’生物信息. 林郑和,孔祥瑞,陈常颂,李鑫磊,张亚真,游小妹,陈志辉,单睿阳,钟秋生. 2023

[13]基于荧光标记的紫娟茶树转录组EST-SSR标记开发. 陈春林,田易萍,陈林波,邓少春,徐丕忠,李朝云. 2018

[14]不同品种茶树新梢响应“倒春寒”的转录组分析. 王君雅,陈玮,刘丁丁,陈亮,姚明哲,马春雷. 2019

[15]中国美利奴羊胚胎骨骼肌发育的加权基因共表达网络分析. 石田培,侯浩宾,王欣悦,赵志达,尚明玉,张莉. 2020

[16]基于WGCNA挖掘谷子淀粉合成相关基因. 胡萌萌,张丽玲,张雅坤,郄倩茹,任碧云,侯思宇,朱喆标,高建华,王海岗,李旭凯,韩渊怀. 2021

[17]利用加权基因共表达网络分析筛选天农麻鸡胴体性状候选基因. 赵迪,康慧敏,谭晓冬,刘冉冉,张正芬,李华,赵桂苹. 2022

[18]普通丝瓜幼苗响应低温弱光核心基因共表达网络的WGCNA鉴定. 王炫榛,陈敏氡,刘建汀,曾美娟,叶新如,李永平,温庆放,朱海生. 2023

[19]甘蓝型油菜盐胁迫响应基因表达谱分析及共表达网络的构建. 杨闯,王玲,全成滔,余良倩,戴成,郭亮,傅廷栋,马朝芝. 2024

[20]基于WGCNA挖掘向日葵抗列当关键基因. 黄启秀,向理军,张黎,沙红,雷中华. 2022

作者其他论文 更多>>