寒地苹果资源遗传多样性及群体结构的SSR标记分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘畅

作者： 刘畅;郭劲鹏;高源;胡颖慧;杨悦;宋宏伟;卜海东;于文全;王昆;顾广军

作者机构：

关键词： 寒地苹果资源;荧光SSR标记;遗传多样性;聚类分析;群体结构

期刊名称： 中国果树

ISSN： 1000-8047

年卷期： 2023 年 005 期

页码： 15-22

收录情况： 北大核心

摘要： 对49份寒地苹果资源采用荧光SSR分子标记技术，并利用GenAlEx 6.501软件进行遗传多样性分析，利用NTSYS 1.2软件进行聚类分析，利用STRUCTURE 2.3.4软件进行群体结构分析。结果表明：20对SSR引物通过DNA扩增共检测出278个多态性等位基因，平均多态性等位基因数为13.850，平均有效等位基因数为6.649，香农多样性指数为2.065，观察杂合度和期望杂合度的平均值分别为0.569和0.799，具有较高的遗传多样性。楸子群体与中国苹果群体间遗传距离最小，为0.261，楸子群体与西洋苹果群体间遗传距离最大，为0.411，属于中度分化。基于UPGMA遗传距离的聚类分析，在遗传距离0.80处49份材料可以分成2个类群，第Ⅰ类包括18份资源，全部是中国苹果群体；第Ⅱ类包括31份资源，其中楸子群体10份，中国苹果群体16份，西洋苹果群体5份。在遗传距离0.81处，第Ⅰ类进一步分为Ⅰa和Ⅰb两个亚类，分别包含5份和13份资源。群体结构分组与聚类分析有相似的结果，发现遗传距离和类群归属与地理位置并不完全相关，各群体间存在基因渗透。

分类号： S661.1

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