德保矮马X染色体选择信号筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘雪雪

作者： 刘雪雪;阿地力江·卡德尔;董坤哲;王月月;潘建飞;浦亚斌;何晓红;马月辉;蒋琳

作者机构：

关键词： 德保矮马;FST;XP-EHH;X染色体;选择信号

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2015 年 46 卷 12 期

页码： 2161-2168

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在对德保矮马(Debao pony)X染色体的选择信号进行筛选。本研究利用Illumina公司开发的马芯片Equine 65KSNP BeadChip,对德保矮马、伊犁马、蒙古马进行X染色体扫描,获得2 339个SNPs位点。通过群体分化系数FST法和XP-EHH两种不同的方法,分别以伊犁马和蒙古马为对照群体对德保矮马进行X染色体选择信号检测。结果,筛选到两个受到较强选择区域4.0~39.9和87.1~123.5Mb,包含64个"离群位点"。通过基因注释筛选到PHEX、BCOR、PNPLA4和GPC3等与生长和骨骼发育相关的基因。研究结果发现,德保矮马的选育过程中X染色体很多与生长相关的基因受到了强烈的选择,其中部分在马中未见报道,可以作为研究矮小性状的重要候选基因。

分类号： S821

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