茶树品种'白鸡冠'与'福云6号'遗传连锁图谱构建

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈志辉

作者： 陈志辉;张亚真;孔祥瑞;游小妹;林郑和;单睿阳;郑士琴;李鑫磊;陈常颂

作者机构：

关键词： 茶树;黄化;白化;遗传图谱;叶色突变

期刊名称： 茶叶学报

ISSN： 2096-0220

年卷期： 2024 年 65 卷 004 期

页码： 8-20

摘要： 【目的】近年来对茶树白化性状调控机理的研究逐渐增多，但到目前为止白化性状的基因调控机制仍然未知。通过构建‘白鸡冠’与‘福云6号’高密度遗传连锁图谱，为后续白鸡冠叶色基因定位奠定基础。【方法】创建白鸡冠（♀）与福云6号（♂）F1代遗传分离群体，采用SLAF-seq技术和HighMap软件开发SNP分子标记，构建高密度遗传连锁图。【结果】用茶树参考基因组作电子酶切预测，选用HaeIII酶切方案。SLAF标签长度选择314～364 bp，预测到230000个SLAF标签。SLAF标签在基因组各染色体上分布基本均匀，酶切方案可行。建库准确性评估发现，对照样数据的双端比对效率为85.98%，酶切效率为91.82%，说明SLAF建库正常。本实验共获得828 448 417条reads(165.67 Gb)测序数据，测序平均Q30为93.94%，平均GC含量为43.67%，样本GC分布正常。获得SNP标记5 975 507个，成功分型的有643 601个，用于遗传图谱构建的标记有500 988个，最终上图标记有7 967个，总图距为2 754.59 cM，上图标记完整度为99.84%，共构建出15个高密度遗传连锁群。【结论】利用白鸡冠与福云6号F1代遗传分离群体构建出含15个连锁群的高密度遗传连锁图谱。

分类号： S571.1

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