口蹄疫病毒A/GDMM/CHA/2013株结构蛋白VP1 H-2d限制性CTL表位预测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 尚延丽

作者： 尚延丽;冯霞;靳野;张晓霞;张柳;马军武

作者机构：

关键词： 口蹄疫病毒;结构蛋白VP1;H-2d限制性T细胞表位;生物信息学

期刊名称： 安徽农业科学

ISSN： 0517-6611

年卷期： 2015 年 16 期

页码： 146-149

摘要： [目的]预测A型口蹄疫病毒结构蛋白VP1的H-2d限制性T细胞表位。[方法]使用多种在线表位预测软件,包括Syfpeithi、IEDB、Net MHC-3.2、IMTECH和BIMAS预测A型口蹄疫病毒VP1上可能有的H-2d限制性T细胞表位,然后用Prot Param软件分析预测出的候选表位。[结果]综合比较5个表位预测软件的预测结果,遴选出10个候选表位;再结合Prot Param软件分析结果,最后共预测出5个表位:其中H-2Kd限制性表位有第27~35、118~126位,H-2Ld限制性表位有第43~51位,H-2Dd限制性表位有第45~53、146~154位。[结论]预测出5条口蹄疫病毒结构蛋白VP1 H-2d限制性CTL表位,为进一步鉴定口蹄疫病毒CTL表位提供数据和基础。

分类号： S852.65

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