甜菜基因组SSR标记特征分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘蕊

作者： 刘蕊;董玉飞;刘乃新;吴玉梅

作者机构：

关键词： 甜菜;基因组SSR;GO分析

期刊名称： 中国甜菜糖业

ISSN： 1002-0551

年卷期： 2019 年 003 期

页码： 5-11

摘要： 简单序列重复(SSR)标记在甜菜遗传和应用研究中得到了广泛的应用,但在甜菜中应用有限.甜菜是世界上重要的糖料作物之一,因此需要开发更多的SSR标记.本研究对甜菜全基因组中简单重复简单重复序列(SSR)进行了鉴定.甜菜基因组共有174218个SSR位点,平均分布频率为463/MB.在甜菜的SSR序列中,五核苷酸(33.32%)>三核苷酸(31.80%)>二核苷酸(20.37%)>六核苷酸(12.51%)>四核苷酸(2.00%).在所设计的27649对引物中,18274对可以特异性扩增,是SSR标记物的37倍.甜菜中含有SSR的蛋白质编码基因与细胞过程、代谢过程、刺激反应和生物调控有关.我们的研究结果将为进一步开发新的SSR标记提供依据,这些标记在甜菜遗传研究的许多方面具有重要价值.

分类号： S566.3

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