生物信息学对扩展莫尼茨绦虫cDNA文库Cavβ基因分析与B细胞抗原表位预测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵文娟

作者： 赵文娟;康立超;王正荣;薄新文;王新华

作者机构：

关键词： 扩展莫尼茨绦虫;Cavβ;二级结构;B细胞抗原表位;功能预测

期刊名称： 新疆农业科学

ISSN： 1001-4330

年卷期： 2012 年 49 卷 04 期

页码： 735-742

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】分离和鉴定扩展莫尼茨绦虫(Moniezia expansa)电压门控钙通道β亚基(Cavβ)基因,预测蛋白二级结构和B细胞抗原表位,从而探讨Cavβ在寄生虫病治疗中所起的作用。【方法】构建扩展莫尼茨绦虫成虫cDNA文库,随机挑取重组阳性克隆进行测序,对部分序列进行引物步移法测序,获取全长cDNA序列;采用生物信息学方法对其对应的蛋白进行二级结构和B细胞抗原表位的预测。【结果】获得扩展莫尼茨绦虫Cavβ基因,全长946 bp,编码180个氨基酸,理论分子质量为19.788 8 kD,等电点为5.06,属于Cachannel B超家族。二级结构以无规则卷曲为主,结构预测存在4个可能的B细胞抗原表位。【结论】研究对于扩展莫尼茨绦虫Cavβ基因的获得和B细胞抗原表位的预测,为该基因功能的试验性鉴定工作奠定了基础。

分类号： S852.7

  • 相关文献

[1]牦牛多杀性巴氏杆菌外膜蛋白OmpH的扩增与生物信息学分析. 赵文娟,田亮,薄新文,马勋,康立超. 2012

[2]鹅多杀性巴氏杆菌OmpH的扩增与生物信息学分析. 赵文娟,康立超,田亮,薄新文,马勋. 2012

[3]副猪嗜血杆菌神经氨酸酶的克隆测序与生物信息学分析. 车勇良,陈如敬,王隆柏,江斌,吴学敏,刘玉涛,庄向生,周伦江. 2013

[4]猪传染性胃肠炎病毒N蛋白的二级结构和B细胞抗原表位的预*测. 姜宁朋,孙健全,黄庆华,王可. 2009

[5]猪传染性胃肠炎病毒S蛋白的二级结构和B细胞抗原表位的预测. 高传庆,王可,黄庆华,韩虹. 2010

[6]猪丹毒杆菌SpaA基因的克隆与生物信息学分析. 林琳,江斌,吴胜会,张世忠. 2013

[7]植物甜蛋白马宾灵(Mabinlin Ⅱ)的二级结构及其B细胞抗原表位预测. 姚晶,顾文亮,夏启玉,胡新文,郭建春. 2012

[8]扩展莫尼茨绦虫基因芯片的制作及分析. 张慧,赵文娟,薄新文,王新华,李娜. 2010

[9]扩展莫尼茨绦虫不同体节翻译延伸因子和引发酶mRNA转录水平研究. 王正荣,薄新文,赵文娟,康立超. 2012

[10]扩展莫尼茨绦虫DAZ基因的分离和cDNA序列分析. 赵文娟,朱建军,吕廷德,薄新文,王新华. 2010

[11]扩展莫尼茨绦虫反应元件结合蛋白基因的克隆和cDNA序列分析. 朱建军,赵文娟,张慧,吕廷德,薄新文. 2009

[12]扩展莫尼茨绦虫烯醇化酶基因的克隆及其组织表达差异分析. 王利晓,薄新文,张银亮,康立超. 2010

[13]用SMART技术构建扩展莫尼茨绦虫成虫全长cDNA文库. 张慧,赵文娟,韩猛立,王新华,薄新文. 2009

[14]扩展莫尼茨绦虫不同体节CREB和PICK基因mRNA转录水平研究. 王正荣,薄新文,赵文娟,何延华,康立超,王新华. 2013

[15]扩展莫尼茨绦虫丝氨酸蛋白酶抑制剂基因serpin部分片段克隆及不同体节mRNA转录水平分析. 叶倩,马勋,薄新文,王正荣,张艳艳. 2015

[16]扩展莫尼茨绦虫β微管蛋白基因的克隆及序列分析. 夏党荣,王涛,薄新文,马勋,何延华,康立超,王新华. 2012

[17]10个生殖发育相关基因在扩展莫尼茨绦虫不同发育节片的mRNA转录水平分析. 王正荣,薄新文,张艳艳,马勋. 2015

[18]扩展莫尼茨绦虫RNA结合蛋白基因的克隆及不同体节mRNA转录水平的分析. 王正荣,薄新文,赵文娟,何延华,康立超. 2013

[19]扩展莫尼茨绦虫膜联蛋白B3基因组织表达差异分析. 王正荣,赵文娟,王新华,薄新文. 2011

[20]扩展莫尼茨绦虫引发酶蛋白基因的克隆和cDNA序列分析. 吕廷德,赵文娟,朱建军,王新华,薄新文. 2009

作者其他论文 更多>>

微信小程序