水牛MFSD2A基因多态性及其与产奶性状的关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 梁莎莎

作者： 梁莎莎;庞春英;邓廷贤;陆杏蓉;段安琴;马小娅;方艳艳;梁贤威

作者机构：

关键词： 水牛;MFSD2A基因;连锁不平衡;产奶性状;关联分析

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2022 年 010 期

页码： 3856-3865

收录情况： 北大核心

摘要： 【目的】研究水牛主要促进因子超家族成员2a（major facilitator superfamily domain containing 2a, MFSD2A）基因多态性，并筛选与水牛产奶性状相关联的SNP。【方法】采集383头健康水牛血液DNA,利用PCR扩增和Sequenom MassARRAY飞行时间质谱技术对SNP位点进行筛选及基因型检测，并进行遗传多样性、连锁不平衡（LD）和单倍型分析，以及对不同基因型和单倍型与水牛产奶性状进行关联分析。【结果】在水牛MFSD2A基因中检出7个SNPs位点，多态信息含量（PIC）均在0.25～0.40之间，属于中度多态，除g.8290 T＞C位点外，其余位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态（P＞0.05）;关联分析结果表明，这7个SNPs位点与305 d产奶量均显著关联（P＜0.05）,且突变杂合子基因型的305 d产奶量是3种基因型中最低的，g.568 C＞G和g.701 A＞G位点与乳脂率显著关联（P＜0.05）,乳脂率从大到小依次为突变纯合子＞野生纯合子＞突变杂合子，g.568 C＞G、g.3326 G＞A、g.8290 T＞C和g.8523 C＞G位点与乳蛋白率显著关联（P＜0.05）,7个SNPs位点与乳尿素氮关联均不显著（P＞0.05）;连锁不平衡和单倍型分析结果明，g.568 C＞G、g.701 A＞G和g.3203 T＞G位点可组成一个单倍型模块（Block 1）,g.8523 C＞G和g.9138 G＞T位点可组成另一个单倍型模块（Block 2）。其中g.568 C＞G和g.701 A＞G、g.568 C＞G和g.3326 G＞A、g.8523 C＞G和g.9138 G＞T位点的r~2分别为0.87、0.37和0.48,处于强连锁不平衡状态。Block 1中的H1（CAG）单倍型乳蛋白率显著高于H2（CAT）和H3（GCT）（P＜0.05）,Block 2中的D3（GG）单倍型305 d产奶量极显著高于D1（CG）和D2（CT）（P＜0.01）。【结论】筛选出的MFSD2A基因7个SNPs位点与305 d产奶量均显著关联，g.568 C＞G和g.701 A＞G位点与乳脂率显著关联，g.568 C＞G、g.701 A＞G、g.3326 G＞A、g.8290 T＞C和g.8523 C＞G位点与乳蛋白率显著关联，这7个SNPs位点与乳尿素氮均无显著关联。纯合子的基因型在高305 d产奶量和乳脂率的选择上更有优势，H1（CAG）和D3（GG）单倍型是提高水牛305 d产奶量和乳蛋白率的有利单倍型。

分类号： S823.83

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