福建省猪流行性腹泻病毒检测与S基因遗传变异分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王隆柏

作者： 王隆柏;吴晓鸣;王晨燕;车勇良;吴学敏;陈如敬;周伦江

作者机构：

关键词： 猪流行性腹泻病毒;检测;S基因;变异分析

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2015 年 07 期

页码： 625-630

摘要： 为了解猪流行性腹泻(PED)在福建省的流行和流行毒株S基因的变异情况,对2011-2014年采自117个规模猪场的295份疑似PED的病料进行检测,对14株具有代表性的PEDV毒株进行S基因序列分析。结果显示,2011-2014年病料阳性率分别为87.30%、75.00%、40.91%和34.15%,总阳性率为69.49%,虽然PED阳性率在福建省有下降趋势,但仍较高。基因序列分析表明福建省14株PEDV分离株S基因核苷酸之间的同源性分别为98.5%~100.0%,与国内其他毒株之间的同源性为93.3%~99.5%,其中与国内2009年以前流行的PEDV毒株的同源性较低;与2008年泰国NPPED2008_2株的同源性分别为95.8%~96.1%;与CV777标准株的同源性为93.8%~94.1%。分离毒株的S基因片段氨基酸存在多个位点突变、插入和缺失现象。遗传进化树表明14株PEDV分离株与2008年泰国NPPED2008_2毒株和2009年韩国毒株亲缘关系较近,与attenuated DR13弱毒株及CV777标准株亲缘关系比较远。14株PEDV的S基因序列已登陆Genbank。

分类号： S858.28

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