基于外壳蛋白基因的广西西番莲夜来香花叶病毒的遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张莉娟

作者： 张莉娟;林垠孚;陆覃昱;莫干辉;单彬;苏文潘;吴凤

作者机构：

关键词： 广西;西番莲;夜来香花叶病毒(Telosma mosaic virus,TeMV);TeMV CP基因;遗传多样性;遗传变异

期刊名称： 中国南方果树

ISSN： 1007-1431

年卷期： 2025 年 54 卷 005 期

页码： 100-106

收录情况： 北大核心

摘要： 为明确夜来香花叶病毒(Telosma mosaic virus,TeMV)在广西地区的发生情况和群体遗传特征,对采集自广西13个市西番莲种植基地的187份疑似感病的西番莲样品进行RT-PCR检测,并选取来自不同产区样品的外壳蛋白(coat protein,CP)基因进行克隆和测序,分析其系统发育、遗传进化、种群结构等特征.结果表明,187份样品中162份检出TeMV,检出率为86.6%,获得22个TeMV CP基因序列(GenBank登录号OR786355~OR786369,PP544171~PP544177).相似性结果表明,22份西番莲TeMV分离物CP基因的核苷酸序列一致性为94.7%~100%,氨基酸序列一致性为95.7%~100%.结合GenBank下载的19条序列的系统发育分析表明,41条序列分为3个大分支,广西西番莲TeMV分离物属于Ⅰ组;不同国家或地区来源的分离物相互分离,且相同寄主来源的分离物亲缘关系最近.西番莲TeMV分离物CP基因序列无重组现象,进化的主要驱动力是负选择压力.不同群组间的遗传分化显著,基因交流频率低,易发生遗传漂变,群体处于扩张趋势.本研究是针对广西地区西番莲上TeMV遗传变异的首次报道,为广西西番莲TeMV防控提供参考.

分类号： S436.67

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