苦荞SRAP分子标记体系优化与遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 令狐斌

作者： 令狐斌;侯思宇;孙朝霞;黄可盛;路阳;韩渊怀;许冬梅

作者机构：

关键词： 苦荞;SRAP-PCR;正交试验设计;遗传多样性

期刊名称： 中国农业大学学报

ISSN： 1007-4333

年卷期： 2015 年 20 卷 01 期

页码： 37-43

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过正交试验设计,比较苦荞序列相关多态性-聚合酶链式反应(Sequence related amplified polymorphism-polymerase chain reaction,SRAP-PCR)扩增反应体系的组合,选出最佳扩增体系用于苦荞SRAP分子标记进行遗传多样性分析。其中最佳SRAP-PCR反应扩增体系为Taq DNA聚合酶2 U、Mg2+1.5 mmol/L、DNA模板75ng、引物0.5μmol/L。从238对SRAP引物组合中筛选出20对多态性较高的引物组合,并对15个苦荞品种进行遗传多样性分析。结果表明:20对引物组合共扩增出128个位点,其多态性信息量(Polymorphism information content,PIC)值在0.66~0.95,每对引物组合扩增位点为7~13个,多态性比率平均值为81.6%,其中多态性信息量值为0.95的引物组合为me7em11、me9em4和me12em8。基于UPGMA法聚类(GS=0.78)可将15个苦荞品种划分为3大类,但这3类划分的品种没有明显的地域分布特征。

分类号： S517

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