鸭胸肌矿物元素含量全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 余大新

作者： 余大新;刘文静;刘大鹏;刘同;张鹤;盖凯;李姝楠;张贝贝;侯水生;周正奎

作者机构：

关键词： 鸭;胸肌;矿物元素;全基因组关联分析;遗传力

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2023 年 004 期

页码： 1287-1295

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】试验旨在利用全基因组关联分析（GWAS）鉴定影响鸭胸肌矿物元素含量的候选基因及分子标记，解析矿物元素性状的遗传机制。【方法】研究构建了北京鸭×野鸭F2代资源群体，利用个体血液样本进行全基因组重测序，采集8周鸭胸肌并根据国标方法测定7种常量矿物元素含量，结合重测序数据与矿物元素表型数据进行全基因关联分析，鉴定影响矿物元素含量相关基因。【结果】7种矿物元素的表型遗传力分别为磷（0.007）＜铁（0.100）＜镁（0.120）＜钠（0.140）＜钾（0.150）＜钙（0.190）＜锌（0.350）。相关性分析结果表明，镁和钾元素相关性最高（r=0.62）,磷与镁、钾元素在鸭胸肌中的含量呈现较高的正相关，r值分别为0.43和0.56。通过GWAS鉴定出与锌元素含量显著相关的1个SNP位点在6号染色体12 075 283 bp处达到全基因组水平上的显著关联(-log10P-value=8.03),与最高点SNP高度相关的39个SNPs将候选区间缩小至39 kb,该区间内仅存在1个基因SORCS3,结合基因功能注释与转录组分析确定SORCS3为锌元素含量变异的候选基因。与磷元素含量表型数据在全基因组水平上达到显著相关的最高点SNP与260个SNPs高度相关（R~2＞0.4）,均位于4号染色体17.1—18.6 Mb之间，且包含27个基因。结合相关性分析、基因功能注释及转录组分析，最终确定6个与磷元素含量高度相关的候选基因：TUSC3、MICU3、LOC101803915、MTMR7、SLC7A2和ASAH1。【结论】本研究利用全基因组关联分析鉴定出鸭胸肌锌元素含量候选基因SORCS3,同时结合转录组分析鉴定出与磷元素含量相关的6个候选基因。结果丰富了禽肉矿物营养的知识体系，为培育优良畜禽产品提供了重要的理论基础。

分类号： S834

  • 相关文献

[1]娄门鸭胸肌性状相关指标的全基因组关联分析. 刘宏祥,沈永杰,张丽华,周腾彬,刘小倩,章双杰,朱春红,朱静,陈晓颖,黄学成,宋卫涛,陶志云,王志成,徐文娟,李慧芳. 2024

[2]高邮鸭和金定鸭胸肌早期发育及MyoD1基因表达分析. 朱春红,陶志云,宋迟,宋卫涛,胡艳,束婧婷,章双杰,李慧芳. 2013

[3]鸭胚胎发育后期胸肌萎缩相关通路及基因鉴定. 刘宏祥,朱春红,宋卫涛,陶志云,徐文娟,章双杰,王志成,李慧芳. 2023

[4]鸭颈胸椎数目变异与其相关性状遗传参数估计. 徐垭烯,胡健,刘贺贺,周正奎,侯水生,刘小林. 2019

[5]鸭胸肌肉色性状全基因组关联分析. 刘大鹏,凡文磊,唐静,周正奎,侯水生. 2020

[6]鸭胸肌肌内脂肪含量全基因组关联分析. 刘文静,凡文磊,刘大鹏,赵金山,周正奎,侯水生. 2021

[7]尾分析法在不同规模群体中开展全基因组关联研究. 武群清,张龙超,黄生强,王立贤. 2017

[8]浙江省主要蛋鸭品种蛋品质测定和遗传力估计. 刘雅丽,尹兆正,任晋东,陶争荣,沈军达,卢立志. 2013

[9]外源T3对鸭胚骨骼肌发育和MyoD mRNA表达的影响. 姬改革,宋迟,陶志云,刘宏祥,朱春红,李慧芳. 2015

[10]高邮鸭MyoD1 SNP位点变异与胸肌发育性状的关联分析. 朱春红,陶志云,宋卫涛,徐文娟,章双杰,刘宏祥,李慧芳. 2016

[11]全脂米糠部分替代玉米对四川白鹅器官指数和胸肌中氨基酸组成影响的研究. 刘航,吴涛,王铕,刘容容,康萍. 2015

[12]超声波法测量肉鸽胸肌厚度及鸽屠宰、体重、体尺性状间的相关分析. 张蕊,汤青萍,穆春宇,常玲玲,付胜勇,卜柱. 2019

[13]文昌鸡与北京油鸡肌肉组织DNA甲基化的MSAP分析. 晁哲,邢漫萍,孙瑞萍,刘海隆,黄丽丽,林哲敏,王峰. 2018

[14]基于鸽胸肌转录组挖掘其卓越飞行性能的分子标记. 刘娜娜,白雪,孙燕勇,特日格勒,付绍印,段仕,刘永斌,张文广. 2020

[15]单色光间歇性刺激胚蛋对肉仔鸡胸肉生长及肉品质的影响. 张林,张海军,武书庚,岳洪源,姚军虎,齐广海. 2012

[16]胚蛋给养β-羟基-β-甲基丁酸对肉仔鸡孵化率、生长性能和骨骼肌发育的影响. 马友彪,张海军,王晶,武书庚,齐广海. 2016

[17]冷藏条件下鸡胸肉新鲜度变化规律及分级研究. 张剑,曹婧,耿爱莲,王海宏,初芹,晏志勋,曾另超,张小月,张尧,刘华贵. 2020

[18]爱拔益加肉公鸡骨骼肌生长发育规律及组织学特性. 王月超,蔡辉益,闫海洁,陈晓琳,张姝,张爱华,杨斌,郭军蕊. 2014

[19]不同日龄阉割对河田鸡胸肌氨基酸含量的影响. 李忠荣,刘庆长,邱华玲,邱其华,朱贵明,刘景,陈鑫珠,林勤. 2024

[20]CSRP3基因在鸡胚胎期胸肌、成肌细胞中的表达及其与胸肌质量的相关性研究. 单艳菊,姬改革,章明,屠云洁,刘一帆,巨晓军,邹剑敏,束婧婷. 2023

作者其他论文 更多>>

微信小程序