甘蓝型油菜SHR蛋白基因鉴定与结构分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘慧萍

作者： 刘慧萍;陈永勤;黄毅;顿小玲

作者机构：

关键词： 甘蓝型油菜;SHR基因;基因结构;氨基酸序列;三级结构

期刊名称： 湖北大学学报(自然科学版)

ISSN： 1000-2375

年卷期： 2017 年 06 期

页码： 620-627

摘要： 植物SHR蛋白属于GRAS蛋白转录因子家族,保守羧基端含有VHIID结构域,氨基端不保守,参与调控植物物质合成和生长发育.参照拟南芥At SHR基因的CDS序列,采用生物信息学的方法在甘蓝型油菜数据库中鉴定出3个Bn SHR基因,进而分析其基因结构、生化特性、进化关系和蛋白结构.研究结果显示3个Bn SHR基因中有2个位于C基因组(来源于甘蓝)上,1个位于A基因组(来源于白菜);3个Bn SHR基因的氨基酸序列一致性为88.25%,与At SHR基因在进化上也高度同源,SHR基因在结构和功能上保守;亚细胞定位预测显示Bn SHR蛋白可能定位于过氧化物酶体,参与种子萌发过程中脂肪转变为糖分的过程;PHYRE2预测了Bn SHR蛋白的三级结构,由于序列的差异性导致了氨基末端处结构相差较大,但VHIID保守区结构类似,为β-折叠.

分类号： Q943.2`S565.4

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