基于转录组分析挖掘平凉红牛背最长肌肉质性状候选基因

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王文翔

作者： 王文翔;杜丽丽;胡俊伟;张琰翔;马铭昊;段蕊;钱聪;王欣玥;李三禄;张长庆;张路培;高雪;徐凌洋;李俊雅;高会江

作者机构：

关键词： 平凉红牛;背最长肌;营养成分含量;转录组

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2023 年 54 卷 011 期

页码： 4589-4604

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在挖掘与平凉红牛背最长肌营养成分含量相关的候选基因,以提高肉品质.本研究选用相同饲养条件下30月龄及750 kg的40头阉牛,测定蛋白质、脂肪和水分3种常规营养成分的含量,分别挑选表型数据具有极端差异的高、低组,每组3个重复.通过主成分分析和比较转录组分析筛选具有显著因子载荷基因(significant factor loading genes,SFLGs)和差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并进行富集分析.利用所有样本的转录组数据和表型数据进行加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA),筛选与表型相关的目标基因模块(r>0.35且P<0.05)与Hub基因(hub genes,HGs).针对蛋白质、脂肪和水分含量3个性状分别鉴定到91、81和80个SFLGs(第一主成分PC1和第二主成分PC2)和18、85和338个DEGs,其中PC1和PC2共有的SFLGs分别有8、4和3个,具有显著因子载荷的DEGs分别有1、3和2个,富集分析结果与相应的表型相关.通过WGCNA分别筛选出2个目标基因模块及10、14和26个HGs,均鉴定到MYADML2和ZBTB14等关键候选基因,其可能在影响三者比例方面发挥重要作用.本研究通过鉴定影响3种常规营养成分含量的候选基因,挖掘到与肉质性状相关的关键基因.研究结果将为平凉红牛的育种工作提供理论基础,同时也为其他肉牛的品质育种提供参考.

分类号： S823.2

  • 相关文献

[1]基于RNA-Seq技术挖掘绵羊背最长肌肉质性状相关基因. 王位,付绍印,何小龙,王艳欣,王月星,王标,刘斌,刘永斌,张文广. 2018

[2]福清山羊与努比亚黑山羊背最长肌比较转录组分析. 刘远,李文杨,吴贤锋,黄勤楼,高承芳,陈鑫珠,张晓佩. 2019

[3]四川麻兔背最长肌DNA甲基化和转录组联合分析. 李钰莹,邝良德,郑洁,李丛艳,郭志强,雷岷,谢晓红. 2024

[4]北京黑猪与杜洛克猪肌内脂肪沉积相关基因的筛选. 白云华,王立贤,陈华林,麻柱,杨超,路永强,王楚端,黄全奎,邢凯,王朝军,薛振华. 2024

[5]牛至精油对平凉红牛生长性能、屠宰性能及肉品质的影响. 白云鹏,张瑞,吴建平,张科,豆思远,李玉,刘婷,程强,王建福,雷赵民. 2020

[6]平凉红牛生长性能、胴体及肉质性状分析. 王秀娟,高翰,李海鹏,高雪,孙宝忠,程强,徐磊,张亚朋,雷元华,魏萌,李三禄,胡俊伟,张长庆,高会江,李俊雅,张路培,陈燕. 2023

[7]平凉红牛生长性状及胴体性状育种值预计趋势研究. 陈丽丽,赵康,张漫,芦娜,刘佳爽,戚星宇,马毅. 2023

[8]基于品牌化思维的平凉红牛产业化开发探究. 张长庆,李浩,黄建伟,王瑨,邹亚宁,何颢,闫晓波,周亚丽,邓倩,牛小雄,王晓谰,周琪,李娜娜,胡俊伟,张路培,孟亚蓉. 2024

[9]平凉红牛遗传资源及选育策略. 徐红伟,周瑞,刘立山,曹忻,高丹丹,蔡勇,郭鹏辉,臧荣鑫,杨具田,雷赵民,吴建平. 2022

[10]平凉红牛牛肉品质性状分析. 钱聪,胡俊伟,王欢,刘璇,雷元华. 2025

[11]不同放牧制度对大针茅草原营养成分及其消化率的影响. 蒙荣,杨劼,包赛娜,金曙光,卫智军. 2004

[12]甜高粱秸秆主要营养成分含量及分布研究. 李冀新,赵志永,武冬梅,王吉亮. 2012

[13]20个青贮玉米品种在陇东南地区的生产性能和营养价值评价. 马学军,左愈臻,刘瑞刚,陈平,谢建鹏,王斐,何振富. 2024

[14]刈割次数对甘肃庆阳地区光敏型高丹草产量及品质的影响. 何振富,贺春贵,王国栋,顾娴,郝生燕. 2019

[15]锈病对豆科牧草生长和营养成分的影响. 南志标. 1990

[16]不同类型饲草高粱生产性能与饲用品质的差异分析. 何振富,贺春贵,王斐,陈平. 2021

[17]四倍体苜蓿家系的建立及遗传变异分析. 苏东,于林清,周延林,孙娟娟,王富贵,乌日娜. 2011

[18]基于营养成分含量的沼液定价方法. 张昌爱,张玉凤,林海涛,沈玉文,杨力. 2012

[19]种植行距对紫花苜蓿生产性能和营养价值的影响. 张德,龙会英,曾丽萍. 2023

[20]猪肌肉组织表达序列标签(ESTs)的分析. 王秀利,仇雪梅,刘娣. 2007

作者其他论文 更多>>

微信小程序