不同环境基于高密度遗传图谱的稻米外观品质QTL定位

文献类型： 中文期刊

第一作者： 彭强

作者： 彭强;李佳丽;张大双;姜雪;邓茹月;吴健强;朱速松

作者机构：

关键词： 水稻;外观品质;QTL;高密度遗传图谱;高通量测序

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2018 年 08 期

页码： 1248-1255

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为解析稻米外观品质遗传基础,挖掘稳定存在的控制稻米外观品质性状的QTL,本研究以籼稻品种V20B和爪哇稻品种CPSLO17作为亲本,构建包含150个重组自交家系(recombinantion inbred line,RIL)的RIL作图群体,进行外观品质性状QTL定位分析。利用特定位点扩增长度测序(SLAF-seq)技术,构建了一个由12个连锁群包含8602个标记,平均间距为0.29 cM的高密度遗传图谱。采用Ici Mapping 4.0软件的ICIM-ADD方法在3种环境(贵阳、贵定、三亚)对4个外观品质性状(粒长、粒宽、垩白度和垩白粒率)进行QTL(quantitative trait locus)定位分析。结果表明:3种环境共检测到9个粒长QTL、6个粒宽QTL、3个垩白度QTL和4个垩白粒率QTL;有5个QTL在多个环境被重复检测到,其中3种环境都定位到的粒宽QTL q GW5-1和垩白度QTL qCha5-1为同一定位区间(第5染色体的Marker1642127-Marker1514505);此外,垩白度QTL qCha5-2的定位区间(Marker1554573-Marker1554589)和垩白粒率QTL qCGP5-2也是一样的。序列比对发现QTL qCha5-1定位区间仅51.5 kb,是新的垩白性状主效QTL。本研究结果不仅为挖掘新的外观品质性状基因奠定基础,也有助于开发新的分子标记进行水稻外观品质性状遗传改良。

分类号： S511

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