基于50K液相芯片分析贵州香稻资源遗传多样性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴娴

作者： 吴娴;王倩;吴朝昕;阙涛;吴钱蓉;龙武华;彭强;朱速松

作者机构：

关键词： 香稻;遗传多样性;液相芯片

期刊名称： 四川农业大学学报

ISSN： 1000-2650

年卷期： 2025 年 43 卷 001 期

页码： 104-110

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]分析贵州香稻资源的群体结构与遗传多样性,促进贵州香稻在育种中的应用.[方法]利用50K液相基因芯片对78份香稻材料、2份不香的贵州培育品种、粳稻对照日本晴、籼稻对照9311共82份进行全基因组基因型检测,开展遗传多样性研究.[结果]经过严格过滤,获得35 344个高质量SNP位点,期望杂合度平均为0.328 2;最小等位基因频率平均为0.216 6;Nei's基因多样性指数平均为0.328 2,标记缺失率平均为0.004 0;Shonnon指数平均为0.506 0;PIC值平均为0.271 4,大于0.250 0的SNPs位点占比达78.59%,说明获得的SNPs标记具有较高的多态性和可信度.群体结构分析表明,有66份资源遗传背景相对比较单一,但材料的少数遗传成分具有多源性;82份水稻资源可被划分为6个亚群,贵州香禾材料共分为3类,说明遗传背景存在差异;而贵州培育香稻与9311聚为一类,多为籼稻材料.[结论]遗传参数结果说明贵州香稻品种间的位点遗传多样性较高,遗传多样性分析表明贵州香禾是一类特殊的香稻,且组间有很好的区分度,遗传背景存在差异;贵州培育香稻多为籼稻材料.

分类号： S511.2%Q756

  • 相关文献

[1]利用130K液相芯片分析中国蚕豆种质资源遗传多样性. 张红岩,敏玉霞,滕长才,彭小星,陈志凯,周仙莉,娄树宝,刘玉皎. 2024

[2]基于120K液相芯片对310份小麦种质的遗传多样性分析. 程斌,丁延庆,曹宁,高旭,徐建霞,罗永露,张立异,王伟. 2024

[3]太湖稻区及国内部分香稻SSR指纹图谱构建及遗传多样性初析. 朱勇良,谢裕林,黄凌哲,吴建祥,乔中英,王建平,黄萌,陈培峰. 2012

[4]我国北方香型粳稻资源遗传多样性及其香味基因Badh2的等位基因分析. 朴日花,金永梅,李萍,陈莫军,孟凡梅,周广春,严永峰. 2021

[5]香稻资源遗传多样性的比较. 唐傲,邵高能,焦桂爱,罗炬,吴建利,唐绍清,胡培松. 2009

[6]广西非香地方栽培稻与香稻的遗传多样性比较. 张向军,陈传华,李容柏,李杨瑞. 2007

[7]香稻品种的遗传多样性研究. 郑家奎,徐建第,蒋开锋,吴先军,汪旭东. 2008

[8]云南地方香稻与非香稻遗传多样性比较. 白现广,程在全,蔺忠龙,吕广磊,黄兴奇. 2009

[9]应用SSR和ISSR标记分析栽培香稻品种的遗传多样性. 王金花,罗文永,陈建伟,刘元风,吴秋花,李晓方. 2005

[10]用SSR标记分析广西香稻与南亚香稻的遗传多样性. 张向军,陈传华,杨新庆,李容柏,李杨瑞. 2008

[11]用第8染色体的SSR标记分析香稻居群遗传多样性. 张向军,陈传华,罗群昌,李容柏,李杨瑞. 2007

[12]国内外香稻资源遗传多样性研究. 余亚莹,邵高能,圣忠华,蒋汉伟,贺记外,孙园园,蔡怡聪,胡培松,唐绍清. 2015

[13]4种重要外来病毒高通量液相芯片检测方法的建立. 仇汝龙,阮智杨,胡波,魏后军,范志宇,宋艳华,陈萌萌,徐为中,王芳. 2021

[14]动物病原高通量检测技术. 朱丽萍,颜世敢. 2011

[15]液相芯片及其在粮油主要真菌毒素同步检测中的应用. 李鑫,李培武,张奇,张文,张兆威. 2012

[16]6种人兽共患病病原核酸液相芯片检测体系的建立. 王艳,沈家红,蒋蔚,张磊萍,张强,林颖峥,熊炜,李树清. 2018

[17]五种重要致病性弧菌高通量液相芯片检测方法的建立. 郭容,董晓妹,别闯南,王权,韩先干,叶建强,蒋蔚. 2021

[18]7种猪繁殖障碍性疫病液相芯片快速检测方法的建立与应用. 邬旭龙,肖璐,杨苗,谢礼,安微,郭杨,张琴,王印,林华. 2023

[19]流行性乙型脑炎病毒、西尼罗病毒、黄热病毒和寨卡病毒四重Luminex xTAG检测方法的建立与应用. 孙俊颖,伍绮文,李吉初,李春红,郭鹏举,黄艺,尹飞飞. 2024

[20]灌浆成熟期水分对香稻香气及生理特性的影响. 田卡,唐湘如,段美洋,钟克友,黎国喜,田华. 2010

作者其他论文 更多>>

微信小程序