中国鸭源H5N6 AIV血凝素和神经氨酸酶基因特征及遗传进化分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 陈翠腾
作者: 陈翠腾;万春和;陈珍;朱春华;傅光华;施少华;蔡国漳;刘斌琼;黄瑜
作者机构:
关键词: 鸭;H5N6亚型禽流感病毒;血凝素;神经氨酸酶;基因特征;遗传进化
期刊名称: 中国家禽
ISSN: 1004-6364
年卷期: 2020 年 01 期
页码: 21-27
收录情况: 北大核心
摘要: 为明确中国鸭源H5N6 AIV的HA和NA基因特征及其遗传变异情况,研究选取了NCBI流感病毒资源库里的32株具有完整ORF编码区的中国鸭源H5N6 AIV的HA和NA基因序列,利用分子生物学软件分析其HA和NA基因特征及其遗传进化情况。结果显示,中国鸭源H5N6 AIV的HA裂解位点有REKRRKR↓G、RERRRKR↓G和KEKRRKR↓G三种类型,HA有6个潜在的N-糖基化位点,其中第182、222、224位氨基酸依次为N、Q、G,具有与禽源唾液酸α-2,3受体结合的特性,然而HA发生了S123P/T、T156A、S223R氨基酸位点突变,部分毒株发生了I151T氨基酸位点突变;HA基因核苷酸遗传进化分析显示,中国鸭源H5N6 AIV遗传进化上均处于clade2.3.4.4分支,并进一步进化出Ⅰ和Ⅱ两个亚分支。部分中国鸭源H5N6 AIV NA第59~69位缺失11个氨基酸,中国鸭源H5N6 AIV NA基因遗传进化上分为两个大的分支,分别对应NA基因颈部缺失型和完整型两种类型;NA颈部完整型的NA有6个潜在的N-糖基化位点,NA颈部缺失型的NA由于第59~69位氨基酸的缺失,导致其第67位丢失了一个N-糖基化位点。研究为中国鸭源H5N6 AIV的生物学特性和遗传进化特征研究奠定基础。
分类号: S852.65
- 相关文献
[1]H9N2亚型禽流感病毒华东分离株的生物学特性及遗传进化分析. 刘慧谋,吴培培,吴双. 2009
[2]水禽源新城疫病毒HN糖蛋白在鸡体内演变. 丁铲,艾静,高勤学,陈鸿军,于圣青. 2007
[3]禽流感病毒与公共卫生. 陈化兰. 2014
[4]禽流感病毒H9N2亚型分离株的全病毒基因序列分析. 李建伟,崔尚金,孟庆文,于康震,金红,唐秀英,田国斌,刘宝全. 2001
[5]禽流感病毒样颗粒疫苗研究进展. 张莹,王成玺,王秀荣,李文超. 2023
[6]猪流感病毒分离株A/Swine/Fujian/F1/2001(H5N1)表面蛋白基因序列分析. 李婷,朱启运,冉多良,陈化兰. 2006
[7]防治“禽流感”兽药选择探讨. 李桐,李景文,何静,霍晓伟,李铁骊,张敏秋,李荣,李耀庭,沈荣显. 2005
[8]中国流行的2009甲型H1N1猪源流感病毒HA和NA基因的分子和遗传特征. 闫丽萍,周艳君,李国新,于海,童光志. 2010
[9]鸭源H5N1亚型禽流感病毒分离株的致病性及表面蛋白基因序列分析. 杨德全,李雁冰,施建忠,陈化兰,张书霞. 2008
[10]鸭源H9N2 AIV血凝素基因序列比较. 万春和,傅光华,程龙飞,施少华,陈红梅,彭春香,林芳,林建生,黄瑜. 2012
[11]H9N2亚型AIV福建分离株血凝素蛋白的特征. 万春和,黄瑜. 2016
[12]鸭β-防御素2基因的克隆、表达和表达产物的生物学特性分析. 王瑞琴,廖文艳,马得莹,韩宗玺,刘胜旺. 2009
[13]鸡传染性支气管炎病毒CK/CH/LDL97 Ⅰ/97株S基因特征. 刘昕,刘胜旺,孔宪刚,张庆霞,荣骏弓,韩宗玺,邵昱昊. 2006
[14]奥利亚罗非鱼、尼罗罗非鱼MyoD1和MyoD2基因特征及差异. 卢中华,俞菊华,李红霞,李建林,唐永凯,阮瑞霞,杨光. 2010
[15]非洲猪瘟病毒的基因特征. 谢春芳,于瑞嵩,董世娟,陈冰清. 2020
[16]鸡传染性支气管炎病毒CK/CH/LDL97Ⅰ/97株S基因特征. 刘昕,刘胜旺,孔宪刚,张庆霞,荣骏弓,韩宗玺,邵昱昊. 2006
[17]貉狐源阿留申病病毒的感染检测与基因特征. 邵西群,章秀婷,于淼,贾博寅,岳志刚,杨福合. 2015
[18]鸡传染性支气管炎病毒CK/CH/LDL97Ⅰ/97株S基因特征. 刘昕,刘胜旺,孔宪刚,张庆霞,荣骏弓,韩宗玺,邵昱昊. 2006
[19]魁蚶HIF-1α基因结构特征及对低氧胁迫的响应. 张高伟,吴彪,刘志鸿,周丽青,孙秀俊,赵庆,杨爱国. 2019
[20]拟腹吸鳅属鱼类线粒体基因组特征与系统发育分析. 宋小晶,凌建忠. 2024
作者其他论文 更多>>
-
藏猪的基因组重测序初步分析
作者:赵梦诗;普布扎西;李兆龙;施少华;赵红阳;李沛民;周彪;邱金华
关键词:藏猪;基因组;重测序
-
DHAV-3弱毒活疫苗株(HB80株)与野毒株鉴别检测的RT-PCR-RFLP方法的建立
作者:傅秋玲;万春和;焦文龙;韩相敏;程龙飞;陈珍;赖志;陈红梅;梁齐章;江南松;刘荣昌;施少华;陈翠腾;苏敬良;黄瑜;傅光华
关键词:鸭3型甲肝病毒;野毒株;弱毒疫苗株;聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性方法;鉴别
-
无乳链球菌抑菌中草药的筛选及其穿透尼罗罗非鱼体血脑屏障能力的研究
作者:郑梦婕;李梓昕;陈杨慧;蔡佳;黄瑜;汤菊芬;牟希东;杨叶欣;王蓓
关键词:尼罗罗非鱼;血脑屏障;无乳链球菌;巴西苏木素;LC-MS
-
多杀性巴氏杆菌:研究现状的回顾与面临的挑战
作者:江南松;陈红梅;黄瑜;程龙飞
关键词:多杀性巴氏杆菌;流行病学;病理机制;诊断技术;耐药性;治疗策略
-
大黄鱼寄生性盾纤毛虫PCR检测方法的建立与应用
作者:池洪树;柯翎;林能锋;方勤美;陈永聪;施少华
关键词:大黄鱼;盾纤毛虫;PCR检测;核糖体小亚基基因
-
过表达VIM基因的LMH细胞系构建及对GAstV增殖效率的影响
作者:唐铮;向勇;孙敏华;冯赛祥;廖明;黄瑜;万春和;刘荣昌;傅光华;罗开健
关键词:波形蛋白基因;鸡肝癌细胞系;基因过表达;鹅星状病毒;增殖效率
-
一例鸭疫里默氏菌血清2型与血清7型共感染的诊断与治疗
作者:李卫;程宁宁;黄林娜;黄瑜;傅光华
关键词:鸭疫里默氏菌;血清2型;血清7型;共感染
