猪源冠状病毒ORF3和ORF7的克隆及特性分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 李建强

作者: 李建强;柳纪省;程杰;兰喜;胡永浩;吴润;殷相平;李宝玉

作者机构:

关键词: 猪源冠状病毒;传染性胃肠炎病毒;ORF3;ORF7;克隆

期刊名称: 甘肃农业大学学报

ISSN: 1003-4315

年卷期: 2007 年 42 卷 06 期

页码: 1-7

收录情况: CSCD

摘要: 参照GenBank中Purdue株全序列对TGEV(猪传染性胃肠炎病毒)TS株的ORF3和ORF7各设计1对特异性引物,经RT-PCR扩增分别获得了1 487 bp和516 bp大小的两个片段,与预期结果大小相符.TS株与CHV株、Puedue株、BW021898B株和KT2株的ORF3a核苷酸序列同源性分别为99.1%、93.0%、95.9%、94.4%,相应的氨基酸同源性分别为97.3%、87.8%、93.2%、91.8%,TS株与CHV株、Puedue株、BW021898B株和KT2株的ORF3b核苷酸序列同源性分别为99.5%、98.5%、97.0%、97.8%,相应氨基酸的同源性分别为98.4%、96.3%、94.3%、95.8%,而TS株与PRCVIA1894株的ORF3b核苷酸和氨基酸同源性分别为96.6%和93.9%.TS株ORF7没有发生缺失且和其他毒株有很高的同源性.结果表明:TGEV非结构蛋白高变区在ORF3a第192个碱基至终止密码子之间,TGEV和PRCV在编码ORF3b氨基酸的数量和RNA酶结合位点上有一定的差异.

分类号: S852.65

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