西瓜核心种质遗传多样性分析及指纹图谱构建

文献类型： 中文期刊

第一作者： 徐彦刚

作者： 徐彦刚;姚协丰;李良俊;徐锦华;任润生;张曼;刘广;娄丽娜;朱凌丽;侯茜;徐建;羊杏平

作者机构：

关键词： 西瓜;SSR多态性标记;遗传多样性;群体结构

期刊名称： 分子植物育种

ISSN：

年卷期： 2021 年 001 期

页码： 305-317

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 深入了解西瓜核心种质资源的群体结构及遗传多样性,可以准确指导亲本间杂交组合的有效配置,避免具有相似遗传背景材料的组合,以便提高育种效率。据此,本研究通过采用45对具有多态性的SSR标记对不同来源的78份西瓜核心种质进行了多元统计分析。结果表明,45个SSR标记共检测出175个位点,其中具有多态性位点数为165个,多态性比率达95.41%,且每对引物平均检测到等位基因位点3.67个,PIC大小范围在0.049～0.781之间,平均值为0.415,其有效等位基因数（Ne）、期望杂合度（He）、观测杂合度（Ho）、多样性指数（I）及Nei’s基因多样性指数（H）在该群体水平上分别为2.258、0.479、0.521、0.850和0.476,同时筛选出了28对多态性高、带型稳定、易于统计的核心引物,构建了78份西瓜核心种质的SSR指纹图谱。群体结构分析表明,78份西瓜核心种质资源划分为2大类群和4个亚群,其中来自不同地域的美国材料和日本材料分别独立趋于2大类群中,而中国种质材料普遍交叉分布于2大类群中,且各亚群之间存在着明显的基因交流,分子方差分析表明种质间遗传多样性主要存在于品种间和居群间。

分类号： S651

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