大白菜高通量SSR标记鉴定体系的建立和应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张晗

作者： 张晗;王东建;孙加梅;郑永胜;姚凤霞;许金芳;宋国安;段丽丽;李华;王雪梅;李汝玉

作者机构：

关键词： 大白菜;SSR;品种鉴定;DNA指纹

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2014 年 15 卷 04 期

页码： 815-823

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 大白菜是重要的蔬菜作物,准确鉴定大白菜品种对于大白菜种质资源管理、新品种测试、种子质量检测等具有重要意义。本研究从已定位到大白菜10个连锁群的205个SSR标记中,筛选出30个在连锁群上分布均匀、PCR扩增稳定、带型简单的标记,用于大白菜品种DNA指纹鉴定。对入选的引物用4种荧光染料进行了标记,利用基于毛细管电泳荧光检测的DNA分析仪对SSR扩增产物进行检测。通过比较分析2种不同型号的3台DNA分析仪的扩增片段检测数据,明确了不同DNA分析仪的检测数据间一般存在明显的系统误差。系统误差的大小取决于引物,一般在1~4 bp之间。使用扩增产物的片段长度对各SSR位点的不同等位变异进行命名。通过使用一组参照品种,消除了不同批次、不同DNA分析仪型号间的系统误差,保证了检测数据的可重复性和可再现性。在此基础上,对184份大白菜品种进行了DNA分子数据采集。

分类号： S634.1

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