芥菜Trihelix转录因子家族全基因组鉴定分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李魁印

作者： 李魁印;段丽丽;胡云;李伟;付文苑;杨巍;唐兵;常向彩

作者机构：

关键词： 芥菜(Brassica juncea);Trihelix家族;全基因组鉴定;生物信息分析;表达分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2025 年 23 卷 003 期

页码： 733-747

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： Trihelix转录因子在调控植物的生长发育、生理代谢和响应逆境胁迫等方面起重要作用。为了研究芥菜Trihelix基因家族的生物学功能和参与调控茎膨大的机理，从芸薹属基因组数据库下载芥菜基因组数据，结合从转录组数据，对芥菜Trihelix转录因子家族成员进行鉴定，运用生物信息学方法在芥菜全基因组数据库中鉴定出81个Trihelix家族成员。利用生物信息软件对芥菜的Trihelix家族成员进行全面分析，包括理化性质分析、染色体定位、亚细胞定位、系统发育关系、共线性分析、基因结构及保守基序分析、茎膨大时期的特异性分析。根据亲缘关系分为4个亚家族，并且基因结构分析、保守基序分析与聚类分析具有一致性。表达模式分析显示Trihelix家族基因可能在芥菜茎膨大中起重要作用。在鉴定出的81个芥菜Trihelix家族基因成员中，SIP1亚组成员在芥菜茎发育时期特异性表达，推测在芥菜茎的生长发育过程中起重要作用，其中BjuA010701、BjuB046251、BjuB046548、BjuB042327、BjuB023618、BjuA017962在茎瘤芥茎的不同发育阶段表达量较高，可为芥菜的发育研究提供候选基因。该研究同时也为其他植物中Trihelix家族的鉴定提供了基础，为进一步明确芥菜Trihelix家族转录因子的生物学功能提供依据。

分类号： S637

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